112 司法特考三等 鑑識人員 生物化學 考古題詳解

112 年・司法特考・三等・鑑識人員
試題代碼 生物化學

第 一 題25 分

請說明膠原蛋白(Collagen)在結構及胺基酸組成上之特色。(10 分)

並說明人體缺乏維生素 C 會造成壞血病(scurvy)之生化機轉。(15 分)

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核心觀念

本題考查膠原蛋白的分子結構、特殊胺基酸組成,以及維生素 C 在膠原蛋白成熟過程中的作用。答題時,先說明膠原蛋白的三股螺旋與重複序列,再連結維生素 C 缺乏如何影響膠原蛋白交聯、結締組織強度及壞血病症狀。

解題方法

一、膠原蛋白的結構及胺基酸組成

膠原蛋白是結締組織的重要纖維蛋白,常見於皮膚、骨、軟骨、肌腱、韌帶及血管壁。其基本結構特色如下:

  1. 三股螺旋結構:每條膠原多肽鏈(α 鏈)形成左手螺旋,三條 α 鏈再彼此纏繞,形成右手超螺旋的三股螺旋結構,稱為 tropocollagen。
  2. 重複序列:胺基酸序列常以 Gly–X–Y 為重複單位,其中 X、Y 常為脯胺酸(proline)及其羥化產物羥脯胺酸(hydroxyproline)。
  3. 甘胺酸含量高:每第三個位置幾乎都是甘胺酸(glycine)。甘胺酸側鏈只有一個氫原子,體積最小,能進入三股螺旋中央狹窄的空間,讓三條鏈緊密排列。
  4. 脯胺酸與羥脯胺酸豐富:脯胺酸限制多肽鏈的構形,使鏈維持適合三股螺旋的形狀;羥脯胺酸有助於穩定三股螺旋,主要透過增加鏈間穩定作用。
  5. 羥化與交聯:部分脯胺酸及離胺酸(lysine)殘基會在膠原成熟過程中被羥化,羥離胺酸也參與後續的分子間交聯。交聯使膠原纖維具有較高的抗拉強度。

二、維生素 C 缺乏造成壞血病的生化機轉

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第 二 題25 分

酵母菌如何由糖解作用之最終產物產生乙醇?請說明其代謝途徑所需之酵素及所參與的輔酶或金屬離子。(10 分)

另請說明乙醇在人體的代謝途徑,並由代謝機制的角度說明過量乙醇對肝臟的傷害。(15 分)

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核心觀念

本題分成兩段:酵母菌將糖解作用產生的丙酮酸轉成乙醇,以及人體氧化乙醇的途徑與其造成肝損傷的代謝機制。作答時應交代各步驟的反應物、產物、酵素與輔因子,並說明乙醇代謝造成的氧化還原狀態改變如何影響肝細胞。

解題方法

沿著碳骨架追蹤反應即可:酵母菌先將丙酮酸脫羧成乙醛,再將乙醛還原成乙醇;人體則依序將乙醇氧化成乙醛、乙酸,最後轉為乙醯輔酶 A。每個氧化還原步驟同時標出輔酶的變化,便能連結到肝臟傷害機制。

一、酵母菌由丙酮酸產生乙醇

酵母菌在缺氧或氧氣不足時,進行酒精發酵,使糖解作用產生的丙酮酸轉為乙醇,並再生糖解作用所需的 NAD+NAD^+。

  1. 丙酮酸脫羧:

丙酮酸⟶乙醛+CO2\text{丙酮酸} \longrightarrow \text{乙醛} + CO_2

酵素為丙酮酸脫羧酶(pyruvate decarboxylase)。此酵素需要焦磷酸硫胺素(TPP,來自維生素 B1B_1)及 Mg2+Mg^{2+}。TPP 參與丙酮酸脫羧與反應中間體的穩定,Mg2+Mg^{2+} 有助於 TPP 與酵素結合及催化。

  1. 乙醛還原成乙醇:

乙醛+NADH+H+⟶乙醇+NAD+\text{乙醛} + NADH + H^+ \longrightarrow \text{乙醇} + NAD^+

酵素為酒精脫氫酶(alcohol dehydrogenase)。此反應以 NADHNADH 提供還原力,將乙醛還原成乙醇,並再生 NAD+NAD^+,供糖解作用中的甘油醛-3-磷酸脫氫酶反應使用。酵母菌酒精脫氫酶通常含有鋅離子作為金屬輔因子。

兩步反應合併後,丙酮酸的羧基碳以 CO2CO_2 形式移除,其餘兩碳形成乙醇;糖解作用產生的 NADHNADH 則在發酵過程中氧化回 NAD+NAD^+。

二、人體乙醇的代謝途徑

  1. 乙醇氧化成乙醛:

乙醇+NAD+⟶乙醛+NADH+H+\text{乙醇} + NAD^+ \longrightarrow \text{乙醛} + NADH + H^+

主要由肝細胞細胞質中的酒精脫氫酶(ADH)催化,使用 NAD+NAD^+ 作為電子受體。飲酒量很大或長期大量飲酒時,平滑內質網中的微粒體乙醇氧化系統(MEOS)也會參與,主要酵素為 CYP2E1,以 NADPHNADPH 和氧為反應所需物質。過氧化氫酶也能在過氧化氫存在下氧化乙醇,但一般情況下不是主要途徑。

  1. 乙醛氧化成乙酸:

乙醛+NAD++H2O⟶乙酸+NADH+H+\text{乙醛} + NAD^+ + H_2O \longrightarrow \text{乙酸} + NADH + H^+

主要由粒線體中的乙醛脫氫酶(ALDH,尤以 ALDH2 為重要)催化,使用 NAD+NAD^+。乙醛具有反應性,若生成量超過肝臟清除能力,會在體內累積並造成細胞傷害。

  1. 乙酸轉為乙醯輔酶 A:
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第 三 題25 分

人類大部分的基因是由許多內含子(intron)和外顯子(exon)所組成。如何讓人類的胰島素原(proinsulin)基因順利在大腸桿菌表現,請說明其實驗流程?(15 分)

並說明如何篩選出會製造胰島素原的菌落?(10 分)

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核心觀念

真核生物的胰島素原基因含有內含子;大腸桿菌沒有剪接體,不能把轉錄本中的內含子剪除。因此,將人類基因組 DNA 直接放進大腸桿菌,通常不能得到正確的胰島素原蛋白。標準做法是先從胰臟 β 細胞取得已完成剪接的胰島素 mRNA,再以反轉錄酶製成不含內含子的互補 DNA(cDNA),將其接入大腸桿菌可辨識的表現載體。

另一個設計重點是區分「前胰島素原」(preproinsulin)與「胰島素原」(proinsulin):前者含有 N 端訊號胜肽;人體細胞會將訊號胜肽切除,形成胰島素原。大腸桿菌不會依人體細胞的方式處理該訊號胜肽,因此應設計只編碼胰島素原的序列,或使用適當的融合蛋白與切割設計。

解題方法與實驗流程

  1. 取得胰島素 mRNA 取人類胰臟 β 細胞,萃取總 RNA,再分離富含 poly(A) 尾端的 mRNA。胰島素 mRNA 已經過真核細胞的 RNA 剪接,保留可編碼蛋白質的外顯子序列。

  2. 合成胰島素原 cDNA 以胰島素 mRNA 為模板,利用反轉錄酶合成第一股 cDNA;再合成第二股,取得雙股 cDNA。以 PCR 擴增胰島素原編碼區,並確認序列。若起始材料是完整前胰島素原 cDNA,須去除訊號胜肽的編碼區,或在表現設計中安排可正確切除的融合區段,使產物為胰島素原。

  3. 建構大腸桿菌表現載體 將胰島素原 cDNA 接入表現載體的啟動子下游,使其具備大腸桿菌可辨識的核糖體結合位點、正確讀框與終止密碼子。載體須含有篩選標記,例如抗生素抗性基因。可直接表現胰島素原,也可讓其與載體中的融合蛋白相連,表現後再以特定方法切割釋出胰島素原。

  4. 將重組載體導入大腸桿菌 以轉形方式將重組質體導入適合表現的菌株。塗布含有相應抗生素的培養基,挑選具有抗藥性、可能帶有質體的菌落。

  5. 確認插入片段並誘導表現 以菌落 PCR、限制酶切分析或定序確認胰島素原 cDNA 已正確插入、方向與讀框正確。將陽性菌落培養至適當生長階段,再依載體設計誘導表現;

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第 四 題25 分

請試述下列名詞之意涵:(每小題 5 分,共 25 分)

(一) Isoelectric focusing(IEF)electrophoresis

(二) Holoenzyme

(三) Calvin cycle

(四) Cori cycle

(五) Sandwich ELISA(enzyme-linked immunosorbent assay)

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核心觀念與解題方法

本題考查五個生物化學名詞的定義、作用原理與生理意義。作答時,先精確界定名詞,再補充其關鍵成分、反應方向或操作原理,並指出常見用途或生理角色;不需列出與題意無關的細節。

(一)等電聚焦電泳(Isoelectric focusing electrophoresis, IEF)

等電聚焦是利用蛋白質或其他兩性分子在穩定 pH 梯度中的淨電荷差異進行分離的方法。施加電場後,分子會朝與其淨電荷相反的電極移動;當分子移至與自身等電點(isoelectric point, pI)相同的 pH 區域時,淨電荷為零,電泳遷移停止,因此聚焦在該位置。

不同蛋白質因 pI 不同而停留在不同位置,故可依 pI 分離。IEF 常用於蛋白質分析,也可與 SDS-PAGE 結合成二維電泳:第一維依 pI 分離,第二維依分子量分離。

**解題技巧:**抓住「pH 梯度」與「移至 pI 後淨電荷為零而聚焦」兩點,即可與單純依分子大小分離的電泳區別。

(二)全酶(Holoenzyme)

全酶是具有完整催化活性的酵素形式,由**蛋白質部分 apoenzyme(酶蛋白)與必要的非蛋白質輔因子(cofactor)**結合而成:

Holoenzyme=Apoenzyme+必要輔因子\text{Holoenzyme}=\text{Apoenzyme}+\text{必要輔因子}

輔因子可為金屬離子,也可為有機分子。有機輔因子若緊密或永久結合於酵素,常稱為輔基(prosthetic group);若以較鬆散、可分離的方式參與反應,常稱為輔酶(coenzyme)。缺少必要輔因子的 apoenzyme 通常不具完整催化活性。

**解題技巧:**記憶「apoenzyme 是蛋白質部分;holoenzyme 是蛋白質加必要輔因子後的完整活性酵素」。

(三)卡爾文循環(Calvin cycle)

卡爾文循環又稱 Calvin–Benson cycle,是光合作用中固定二氧化碳並合成醣類前驅物的代謝循環,發生於葉綠體基質。它不直接利用光子,但所需的 ATP 與 NADPH 由光反應提供。

循環可分為三階段:

  1. **碳固定:**酵素 RuBisCO 將 CO₂ 固定至核酮糖-1,5-二磷酸(RuBP),形成不穩定的六碳中間物,隨即分解為 3-磷酸甘油酸(3-PGA)。
  2. **還原:**3-PGA 使用 ATP 與 NADPH 還原,形成甘油醛-3-磷酸(G3P)。
  3. **RuBP 再生:**部分 G3P 用於再生 RuBP,使循環得以持續;其餘 G3P 可作為合成醣類的碳源。

固定 3 個 CO₂,淨產生 1 個 G3P 約需消耗 9 個 ATP 與 6 個 NADPH;G3P 是三碳產物,後續可用於合成葡萄糖等碳水化合物。

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