110 專利師高等考試 專利師(選試專業日文及生物技術) 生物技術 考古題詳解
第 一 題20 分
甲狀腺癌可以利用競爭性等位基因特異性聚合酶鏈鎖反應(Competitive allele specific TaqMan PCR, CAST-PCR)檢驗方法針對 BRAF V600E 基因突變進行檢驗;請說明 CAST-PCR 技術原理。
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核心觀念
CAST-PCR(Competitive allele-specific TaqMan PCR,競爭性等位基因特異性 TaqMan PCR)是用來在大量野生型 DNA 背景中,選擇性擴增並偵測低比例突變等位基因的即時定量 PCR 方法。它結合兩種選擇性設計:
- 突變等位基因專一性引子(allele-specific primer, ASP):引子的 3′ 端設計在突變位點上,與目標突變序列完全互補;若模板為野生型,3′ 端會形成錯配,延伸效率大幅降低。
- 野生型等位基因阻斷寡核苷酸(allele-specific blocker, ASB):與野生型序列互補,優先結合野生型模板,阻止突變專一性引子在野生型模板上結合或延伸。阻斷寡核苷酸通常帶有 MGB(minor groove binder)等修飾,且 3′ 端不可延伸。
因此,CAST-PCR 的「競爭」是指 ASP 與 ASB 針對不同等位基因模板競爭結合:突變模板由 ASP 引發擴增;野生型模板則由 ASB 占據並受到抑制。
解題方法
以 BRAF V600E 為例,該突變是 BRAF 基因第 600 位胺基酸由纈胺酸(Val)變成麩胺酸(Glu),其常見核苷酸變化為第 1799 位由 T 變成 A(c.1799T>A)。
反應中主要包含:
第 二 題20 分
請說明蛋白質截斷試驗(Protein truncation test, PTT)原理和應用。
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核心觀念
蛋白質截斷試驗(Protein truncation test, PTT)是以體外轉錄與轉譯產物的長度,篩檢會造成蛋白質提前終止的基因變異。若待測基因片段含有無義突變、移碼突變,或會改變轉譯讀框的剪接異常,轉譯可能在正常終止點之前停止,生成較短的多肽。將受試者與正常對照的轉譯產物分開分析,即可判斷是否出現截短蛋白。
本題的重點是說明 PTT 的檢測原理、實驗流程、可偵測的變異類型、應用及限制。它是功能性篩檢法,可提示變異造成的蛋白質長度改變,但通常不能單靠 PTT 確認變異的精確核苷酸位置。
解題方法:原理與實驗流程
可依「取得待測序列 → 體外表現 → 比較蛋白質大小 → 確認變異」說明:
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取得待測基因片段 從適當檢體取得 RNA,經反轉錄形成 cDNA,再以 PCR 擴增目標基因的編碼區;也可使用基因組 DNA 擴增適當片段。實驗常將啟動體外轉錄所需的啟動子序列設計在 PCR 引子中。若待測基因只在特定組織表現,檢體必須能提供足量且適當的轉錄本。
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體外轉錄與轉譯 將擴增產物送入無細胞的體外轉錄/轉譯系統,產生多肽。產物可用放射性標記胺基酸、帶標記的蛋白質或標籤抗體等方式偵測。
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分離並比較多肽長度 以 SDS-PAGE 等方法分離產物,與正常對照比較。正常型通常出現預期長度的全長蛋白;若待測片段產生提前終止,會出現分子量較小、電泳移動較快的截短多肽。異常條帶的位置可大致反映提前終止的位置。
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確認變異位置與性質 PTT 出現截短產物時,代表待測區域可能含有造成提前終止的變異;後續應以 DNA 定序等方法確認具體變異,並評估其生物學及臨床意義。
無義突變會把原本編碼胺基酸的密碼子轉成終止密碼子;移碼突變則常由非三的倍數核苷酸插入或缺失造成,使突變點之後的讀框改變,並可能形成提前終止密碼子。若剪接異常使轉錄本讀框改變,也可能產生類似的截短結果。
應用
第 三 題20 分
流感是一種急性呼吸道傳染病,具有爆發流行及嚴重併發症的特性,對於民眾的健康威脅甚鉅,請說明流感疫苗之特性。
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核心觀念
本題要說明流感疫苗的種類、抗原組成、免疫保護特性、接種時機與限制。流感病毒主要包括 A 型與 B 型;表面抗原血球凝集素(HA)與神經胺酸酶(NA)會發生變異,使既有抗體對新流行株的辨識能力下降。疫苗因此須依流行病學監測結果定期更新,接種後也不能提供終身或對所有流感病毒株都相同的保護。
解題方法
依「疫苗如何製成 → 為何須更新 → 能提供何種保護 → 接種時應注意什麼」的順序作答,可完整交代疫苗特性,並說明其與流感病毒快速變異及季節性流行的關係。
流感疫苗的特性
一、疫苗種類與抗原組成
流感疫苗可按製備方式分為不活化疫苗與活性減毒疫苗;考試作答時也可補充重組疫苗等製備方式。不活化疫苗含已失去感染能力的病毒或病毒抗原,常見製品為肌肉注射劑型;活性減毒疫苗使用減毒病毒,常見為鼻噴劑型。不同疫苗的適用對象與禁忌依產品及接種指引而定。
季節性疫苗通常涵蓋預期流行的 A 型與 B 型病毒株。傳統三價疫苗包含兩種 A 型病毒株與一種 B 型病毒株;四價疫苗則另含一種 B 型病毒株。實際組成依當年推薦株及疫苗產品而定。
二、須定期更新,通常每年接種
流感病毒表面抗原會持續變化:
- 抗原漂移(antigenic drift):病毒基因累積小幅變化,使 HA、NA 抗原逐漸改變,是季節性流行株變化的重要原因。
- 抗原轉換(antigenic shift):主要發生於 A 型流感病毒,因基因片段重新組合而造成較大幅度的抗原改變,可能使人群普遍缺乏免疫力,並引發大流行。
第 四 題20 分
全球新冠肺炎(COVID-19)大流行,為保障大眾健康安全,可藉由病毒抗原和抗體快篩掌握疫情,請說明 SARS-CoV-2 病毒抗原和抗體快篩原理。
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核心觀念
本題在考 SARS-CoV-2 快速檢測中,病毒抗原檢測與人體抗體檢測的辨識對象及免疫分析原理。兩者多採用免疫層析法(lateral flow immunoassay):檢體沿試紙毛細移動,與標記的抗體或抗原結合,再於測試線形成可見訊號。
- 抗原是病毒本身的特定成分,例如核殼蛋白(N protein);抗原快篩是用抗體捕捉並辨認病毒抗原。
- 抗體是人體感染後產生、能專一性結合病毒抗原的免疫球蛋白;抗體快篩是用病毒抗原偵測檢體中的人體抗體。
解題方法
依序說明兩種快篩的「檢測標的、試紙上的辨識分子、訊號形成方式」,並指出測試線與控制線的功能,即可完整交代檢測原理。
一、病毒抗原快篩
- 將鼻咽、鼻腔或其他指定部位的檢體加入試紙,檢體中的病毒抗原隨液體移動。
- 抗原與結合有顏色微粒(如金奈米粒子、乳膠微粒)的標記抗體結合,形成抗原—標記抗體複合物。
- 複合物移至測試線(T 線),被固定於線上的另一株、辨認不同表位的捕捉抗體結合,形成「捕捉抗體—抗原—標記抗體」夾心複合物。累積的標記微粒顯示可見色線。
- 控制線(C 線)通常捕捉標記抗體,用來確認液體流動及試劑運作正常。
因此,T 線與 C 線皆出現表示檢測呈陽性;只有 C 線表示陰性;沒有 C 線則為無效,須依產品說明判讀。
二、人體抗體快篩
第 五 題20 分
臺灣位於亞熱帶地區,有點熱又有點溼的環境,正是蚊子最喜歡的生長環境,為登革熱流行高風險地區,請說明登革病毒分離與鑑定。
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核心觀念
登革病毒(dengue virus, DENV)屬黃病毒科,是具套膜的單股正鏈 RNA 病毒,分為 DENV-1、DENV-2、DENV-3、DENV-4 四種血清型。題目考查的是兩個連續步驟:先讓臨床檢體中的病毒在易感細胞中增殖,以分離病毒;再用免疫學或分子生物學方法確認病毒身分及血清型,以鑑定病毒。
病毒分離需選擇仍有病毒血症的急性期檢體;檢體若延遲處理或保存不當,病毒活性會降低,分離成功率也會受影響。登革病毒鑑定除確認是否為 DENV 外,通常還須判定血清型。
解題方法
一、採集及處理檢體
採集病人發病初期的血清或血漿,必要時可使用組織檢體。登革病毒在急性期、病毒血症期間較容易從血液檢體分離;檢體應儘速送驗並依實驗室規範低溫保存,避免反覆凍融,以維持病毒感染力。
二、接種易感細胞進行病毒分離
將檢體接種於蚊媒細胞株,常用的是白線斑蚊來源的 C6/36 細胞。接種後在適當條件下培養,常見設定約為 ,培養數日後收集細胞或培養液,供後續檢測。若首次培養未檢出病毒,可依實驗室標準流程延長觀察或盲目繼代培養。
病毒培養期間可觀察細胞變化,但不能只憑細胞病變效應判定登革病毒;是否分離到 DENV,仍須進一步以特異性方法確認。