112 公務人員升官等薦任 動物技術 家畜育種學 考古題詳解

112 年・公務人員升官等・薦任・動物技術
試題代碼 家畜育種學

第 一 題20 分

定義何為重複性狀(repeated trait)?並舉兩例說明。重複性狀的數量性狀遺傳模型為何?並針對模型中的每個效應予以說明。

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核心觀念

本題測驗數量遺傳學中「重複度量資料(Repeated Records)」的基礎架構與變異剖分原理,核心概念包含:

  1. 重複性狀(Repeated Trait):同一個體在生命週期中可多次表現並被重複測量的性狀。
  2. 環境效應的二分法:將總環境效應(EE)拆解為「永久環境效應(Permanent Environmental Effect, PEPE)」與「暫時環境效應(Temporary Environmental Effect, TETE)」。
  3. 生產能力(Producing Ability, PAPA):個體遺傳效應與永久環境效應的總和(PA=G+PEPA = G + PE),決定個體各期生產表現的基準水準。
  4. 重複率(Repeatability, rr)之基礎:各次測量間之表型相關係數,其分子包含遺傳變異與永久環境變異。

解題方法

本題為典型結構化申論題,作答切入點與層次如下:

  1. 定義性狀:精確點出「同一個體」、「不同時間/胎次」、「多次記錄」三個關鍵要素。
  2. 舉例說明:挑選家畜生產中具重要經濟價值、胎次或年度間重複記錄之經典性狀,避免舉出如「屠宰率」等破壞性(僅能測量一次)的性狀。
  3. 建立模型:寫出經典單性狀重複記錄之統計遺傳學線性模型,明確標註下標(個體與測量次數)。
  4. 剖析各效應:依序說明總平均、遺傳效應(可進一步細分為加性與非加性)、永久環境效應及暫時環境效應的生物學意涵與統計假設。

選項分析

本題非選擇題,為申論題型;各子題作答重點與評分標準剖析如下:

  • 子題一(重複性狀定義):需指出表型於個體一生中非單一固定值,但各次觀測值具高度相關性。若僅寫「可測量多次的性狀」而未強調「同一個體在不同時期/環境下的重複表現」,難以取得滿分。
  • 子題二(兩項實例):必須列舉不同生理階段重複發生的性狀(如母牛各胎產乳量、母豬各胎產仔數、綿羊各年度剪毛量)。若舉「不同日齡之體重」,因牽涉生長發育遺傳背景之動態變化(常視為不同但高度相關之性狀),不如胎次生產性狀來得標準穩妥。
  • 子題三(遺傳模型):必須寫出完整的代數模型式。常見扣分點為遺漏「永久環境效應」,將模型誤寫為一般數量性狀的 P=μ+G+EP = \mu + G + E。
  • 子題四(各效應說明):關鍵在於清楚對比 PEPE 與 TETE 的差異——PEPE 伴隨個體終生但不遺傳給後代,TETE 僅影響單次記錄且隨機變動(其期望值為 0)。

解題技巧

  1. 架構聯想:重複性狀之表型值可視為「基準生產能力」加上「當次環境隨機擾動」,即: P=μ+PA+TEP = \mu + PA + TE 其中: PA=G+PE=A+GNA+PEPA = G + PE = A + G_{NA} + PE
  2. 防錯驗證(重複率與遺傳率之關係): 重複性狀的模型奠定了重複率公式: r=σG2+σPE2σP2=σPA2σP2r = \frac{\sigma^2_G + \sigma^2_{PE}}{\sigma^2_P} = \frac{\sigma^2_{PA}}{\sigma^2_P} 由於分子包含 σPE2\sigma^2_{PE},故重複率必大於或等於狹義遺傳率(r≥h2r \ge h^2)。此邏輯可用於檢驗模型中效應劃分是否周全。
  3. 下標規範:務必清楚標記個體下標 ii 與次數下標 kk,展現嚴謹之數量遺傳學答題格式。

【答案】

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第 二 題20 分

大規模遺傳評估的主要目的為何?其評估項目有哪些?這些評估項目如何協助產業做遺傳改進?

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核心觀念

本題聚焦於現代家畜育種學的核心支柱——大規模遺傳評估(Large-Scale Genetic Evaluation, LSGE)。此評估主要藉由跨群體(跨場、跨國)蒐集的表型性能與系譜(或基因體單核苷酸多型性 SNP)資料,利用混合模型方程式(Mixed Model Equations, MME)與最佳線性不偏預測法(Best Linear Unbiased Prediction, BLUP,如個體動物模型 Animal Model 或單步基因體 BLUP, ssGBLUP)進行運算。

核心公式與理論基礎:

  1. 動物模型(Animal Model)線性混合模型: y=Xb+Za+e\mathbf{y} = \mathbf{Xb} + \mathbf{Za} + \mathbf{e} 其中 y\mathbf{y} 為表型觀測值向量;b\mathbf{b} 為固定效應向量(如場別-年-季同期群 contemporary group、產次等);a\mathbf{a} 為隨機加性遺傳效應向量(即個體育種價,a∼N(0,Aσa2)\mathbf{a} \sim N(\mathbf{0}, \mathbf{A}\sigma_a^2));e\mathbf{e} 為隨機殘差向量;X\mathbf{X} 與 Z\mathbf{Z} 為相應的設計矩陣。
  2. 遺傳進展方程式(Breeder's Equation): ΔG=rTI⋅i⋅σAL\Delta G = \frac{r_{TI} \cdot i \cdot \sigma_A}{L} 其中 ΔG\Delta G 為年遺傳進展量;rTIr_{TI} 為選拔準確度(Accuracy);ii 為選拔強度(Selection intensity);σA\sigma_A 為加性遺傳標準差;LL 為世代間距(Generation interval)。

解題方法

本題屬於標準的三段式申論題,作答時須以**「總體目標 →\to 評估產出與範疇 →\to 產業實踐機制」**由淺入深推展:

  1. 主要目的:切入點為「單場評估的侷限」與「環境偏誤的校正」。說明大規模評估如何藉由群體間的遺傳連結(Genetic ties),消除場間管理、飼養等固定環境偏差,建立客觀可比的育種價值評估體系。
  2. 評估項目:分為「數值評估指標(評估的形式)」與「評估性狀類別(評估的實質內涵)」兩個層次列舉,展現系統性的分類能力。
  3. 如何協助產業遺傳改進:緊扣遺傳進展方程式 ΔG=rTI⋅i⋅σAL\Delta G = \frac{r_{TI} \cdot i \cdot \sigma_A}{L},逐項分析大規模評估對提高準確度(rTIr_{TI})、加大選拔強度(ii)、縮短世代間距(LL)以及透過綜合選拔指數克服負相關性狀的具體機制。

選項分析

本題為申論題,非選擇題,故無個別選項分析。


解題技巧

  1. 破題關鍵在於「模型與參數的對應」:說明目的時,務必點出「將固定環境效應(同期群)與隨機遺傳效應分離」;說明產業應用時,務必帶入 ΔG=rTIiσAL\Delta G = \frac{r_{TI} i \sigma_A}{L},讓回答具備嚴謹的數理基礎,而非泛泛空談。
  2. 評估項目不可只列性狀:許多考生僅列出「產乳量、產肉量」,而忽略了評估指標本身(如 EBV、EPD、PTA、選育指數),必須同時涵蓋「指標形式」與「經濟性狀範疇」。
  3. 避開常見名詞陷阱:
  • 區分育種價(BV)與預期後裔差異(EPD)/預測傳遞能力(PTA),後者為親本傳遞給子代的平均加性遺傳效應,數值為育種價的一半(EPD=12EBV\text{EPD} = \frac{1}{2}\text{EBV})。
  • 區分「表型評鑑」與「遺傳評估」,前者包含大量環境非遺傳因子,不可直接跨場比較。

【答案】

一、大規模遺傳評估的主要目的

大規模遺傳評估(Large-Scale Genetic Evaluation, LSGE)係指跨越單一畜牧場範疇,在區域、國家甚至國際層面,針對特定家畜品種群體所進行的統一遺傳價值評定。其主要目的包括:

  1. 消除環境偏差,分離遺傳與環境效應: 表型值受基因型與環境共同影響(P=G+EP = G + E)。不同牧場間的飼育水準、氣候、管理與設備差異極大;大規模遺傳評估利用統計混合模型(如 BLUP-Animal Model),將「場別-年份-季節」等同期群(Contemporary Group)效應列為固定效應予以剔除,精準預測各個體的加性遺傳值。
  2. 建立跨群體遺傳連結(Genetic Ties),使跨場比較具備統計效力:
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第 三 題20 分

近親配種與遠親配種在畜牧產業的金字塔結構(核心種畜群、繁殖畜群及生產畜群)會如何運用?最主要是為了獲取哪些育種優勢及避免哪些問題?

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核心觀念

本題旨在評量考生對畜牧育種學中「育種體系架構」與「配種制度(Mating Systems)」整合應用的理解深度,核心觀念包含:

  1. 畜牧產業金字塔結構(Pyramid Breeding Structure):核心種畜群(Nucleus herd)、繁殖畜群(Multiplier herd)及生產畜群/商品畜群(Commercial herd)三者之間的遺傳流向與分工定位。
  2. 近親配種(Inbreeding)及其衍生之系祖配種(Linebreeding):
  • 遺傳效應:提高基因同型結合率(Homozygosity),使等位基因固定,提升種畜遺傳傳遞力(Prepotency)。
  • 伴隨風險:近親退化(Inbreeding depression),顯現有害隱性基因(Lethal or deleterious recessive alleles),降低生活力與繁殖力。
  1. 遠親配種(Outbreeding)及其衍生之品種間雜交(Crossbreeding):
  • 遺傳效應:提高基因異型結合率(Heterozygosity),掩蓋有害隱性基因。
  • 育種優勢:產生雜種優勢(Heterosis 或 Hybrid vigor),其雜種優勢率計算公式為: H=Fˉ1−PˉPˉ×100%H = \frac{\bar{F}_1 - \bar{P}}{\bar{P}} \times 100\% (其中 Fˉ1\bar{F}_1 為雜種後代平均表現,Pˉ\bar{P} 為親本平均表現);並發揮品種互補性(Breed complementarity)。

解題方法

本題為典型的制度應用與比較型申論題,作答時宜採取「階層矩陣分析法」切入:

  1. 縱向剖析金字塔結構:由頂層至底層(核心群 →\rightarrow 繁殖群 →\rightarrow 生產群),逐層交代該群體的育種目標、族群規模與所採用的配種方式(近親/純系繁育 vs. 遠親/雜交繁育)。
  2. 橫向歸納育種優勢與防範問題:
  • 針對近親配種:著重說明「固定基因、純化特徵」之優勢,以及如何透過「嚴格淘汰與近交係數監控」避免近親衰退。
  • 針對遠親配種:著重說明「雜種優勢、性狀互補」之優勢,以及如何透過「特定雜交體系(如末端雜交)」避免後代性狀分離與管理成本過高的問題。

選項分析

本題為公務人員升官等考試之申論題,非選擇題型。計分重點在於邏輯層次之完整性,評分標準聚焦於下列四項維度:

  • 層級對應精準度:是否清楚區分核心群(以純系選育、閉鎖控制或系祖配種為主)、繁殖群(純種擴繁或二品種雜交母畜生產)、生產群(全實施終端遠親雜交)。
  • 遺傳學機制闡釋:是否以同型合子化(Homozygosity)與異型合子化(Heterozygosity)原理解釋性狀改變。
  • 優勢論述廣度:是否涵蓋固定優良基因、遺傳均一性、個體雜種優勢、母性雜種優勢與品種互補性。
  • 弊病防範機制:是否明確指出近親退化、致死隱性基因暴露、雜種後代性能分離等風險及產業因應對策。

解題技巧

  1. 破題架構圖表化:答題卷開頭可先繪製簡易金字塔示意圖或對照表,標明「層級」、「族群名稱」、「配種制度」、「主要目的」,使閱卷委員一目了然。
  2. 切忌極端化論述:近親配種並非一無是處,遠親配種亦非萬靈丹。必須強調「金字塔頂層追求純化與高傳遞力,底層追求生產力最大化」之互補功能。
  3. 善用代表性家畜實例:論述時帶入豬的三品種雜交(如核心群純化藍瑞斯 L、約克夏 Y、杜洛克 D;繁殖群生產 LY 二元母豬;生產群利用 D 公豬進行末端雜交生產 LYD 肉豬),能顯著增加作答專業度與說服力。

【答案】

一、金字塔育種結構中近親與遠親配種之具體運用

畜牧產業的金字塔體系透過階層分工,將頂層的遺傳改良迅速且經濟地放大至底層商品群。近親配種與遠親配種在此結構中扮演不同但相互依賴的角色:

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第 四 題20 分

以臺灣的豬隻生產為例,終端公畜雜交制度(terminal sire crossbreeding system)與輪迴雜交制度(rotational crossbreeding system)各有何優缺點?你會建議產業採用哪一種制度?並說明其原因。

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核心觀念

本題測驗家畜育種學中「雜交繁育體系設計(Crossbreeding Systems)」之理論與實務應用,核心考點包含:

  1. 雜種優勢(Heterosis / Hybrid Vigor):雜種後代表現平均值超越其兩純種親本平均值的現象。公式為: H%=F1‾−P‾P‾×100%H\% = \frac{\overline{F_1} - \overline{P}}{\overline{P}} \times 100\%
  • 個體雜種優勢(Individual Heterosis):雜種個體本身在生活力、生長速率、飼料利用率與精肉率的增益。
  • 母體雜種優勢(Maternal Heterosis):雜種母畜在產仔數、泌乳量、排卵數及母性行為等繁殖性狀上的增益。
  1. 輪迴雜交之雜種優勢保留率(Retained Heterosis, RHRH): 在 nn 個品種進行輪迴雜交達平衡狀態時,所保留的雜種優勢比例為: RH%=2n−22n−1×100%RH\% = \frac{2^n - 2}{2^n - 1} \times 100\%
  • 兩品種輪迴(Criss-cross):RH=22−222−1=23≈66.7%RH = \frac{2^2 - 2}{2^2 - 1} = \frac{2}{3} \approx 66.7\%
  • 三品種輪迴:RH=23−223−1=67≈85.7%RH = \frac{2^3 - 2}{2^3 - 1} = \frac{6}{7} \approx 85.7\%
  1. 品種互補性(Breed Complementarity):利用不同品種之優勢性狀(如母系的繁殖力與父系的產肉能力)進行專門化親系配種,使後代集結雙親優點。
  2. 體系定義:
  • 終端公畜雜交制度(Terminal Sire System):所有雜交後代(不論公母)全數作為肉豬育肥上市,不保留女豬作為種用;母豬群必須持續自外部或專門增殖群引入。臺灣最具代表性者為三品種終端雜交(如 藍瑞斯 ×\times 約克夏 產出之 LY 母豬,再配 杜洛克 公豬,產出 LYD 肉豬)。
  • 輪迴雜交制度(Rotational Crossbreeding System):每世代留選雜種女豬作為下一代繁殖母豬,並輪流與不同品種之純種公畜配種,母畜世代交替由場內自我更新。

解題方法

本題為「理論結合產業實務」之申論題,答題策略應採邏輯三段論法:

  1. 制度架構與機轉對比:針對兩制度在「雜種優勢利用率」、「品種互補性」、「後代均一性」與「女豬更新管道(生物安全)」四大構面進行切入,說明遺傳理論依據。
  2. 優缺點系統化梳理:分別列出終端雜交與輪迴雜交之強項與局限。
  3. 產業決策與論證:結合臺灣當前養豬產業型態(專業化分工金字塔體系、人工授精技術成熟度、拍賣市場屠體規格化要求),做出肯定決策並提供充足理據。

制度剖析(申論要點對比)

本題為申論問答題,將兩雜交制度之機制、優缺點及評估指標逐項剖析如下:

1. 終端公畜雜交制度(以臺灣三品種雜交 LYD 為例)

  • 優點:
  • 雜種優勢 100%100\% 完全利用:LY 二品種雜交母豬具備 100%100\% 母體雜種優勢,顯著提升窩產仔數、泌乳量與仔豬存活率;後代 LYD 肉豬則具備 100%100\% 個體雜種優勢,生長發育快、飼料換肉率佳。
  • 極佳的品種互補性:母系選用高產仔、泌乳力強的白豬(藍瑞斯 Landrace、約克夏 Yorkshire);終端父系選用生長快、背脂薄、精肉率高且肉質優異的純種杜洛克(Duroc),使繁殖與產肉兩類拮抗性狀達到完美分工。
  • 後代規格高度均一:所有終端肉豬皆具備固定的遺傳比例(12\frac{1}{2} 杜洛克、14\frac{1}{4} 藍瑞斯、14\frac{1}{4} 約克夏),屠體形質、屠宰率與出肉率穩定一致,利於現代化冷鏈分切與規格化拍賣。
  • 缺點:
  • 無法自我留種更新:因終端後代全數上市,商業生產場本身無法保留雜交女豬,必須定期向種豬增殖場(GP 場)或人工授精站引進純種或二品種(LY)母豬,引種成本較高。
  • 生物安全(Biosecurity)風險較大:經常自場外引入女豬,增加病原體(如 PRRS、PED、非洲豬瘟 ASF 等)隨引種入侵豬場之風險。
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第 五 題20 分

請試述下列名詞之意涵:

(一) 近親係數(Inbreeding Coefficient)

(二) 選拔強度(Selection Intensity)

(三) 遺傳率(狹義)(Heritability, h2h^2)

(四) 基因體選拔(Genomic Selection)

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核心觀念

本題為家畜育種學最具代表性的名詞解釋題,涵蓋「族群遺傳學」、「數量遺傳學」以及「現代分子育種學」四項核心支柱:

  1. 近親係數:衡量個體基因純合度(Homozygosity)與同源同型結合(Identical by Descent, IBD)的機率指標,為族群近親交配與近親退化評估之基礎。
  2. 選拔強度:量化育種選拔嚴格程度的標準化指標,是育種方程式(Breeder's Equation)預測遺傳進展的核心參數。
  3. 狹義遺傳率:加性遺傳變異佔表現型總變異的比率,直接決定選拔反應量(Response to Selection)與個體育種價預測之可靠度。
  4. 基因體選拔:利用全基因體高密度分子標記(如 SNP)預測基因體估計育種價(GEBV)的新世代育種工具,顛覆傳統後裔檢定流程。

解題方法

申論題解答名詞解釋時,切忌僅提供一句通俗白話,應採用「專業三層架構法」鋪陳:

  1. 嚴謹定義與符號表示:給出權威的遺傳學學理定義與標準統計/遺傳代號。
  2. 數學公式與參數說明:列出理論計算公式並清楚定義各項參數變數。
  3. 生物學意涵與育種實務應用:闡述該參數在畜產實務(選拔決策、配種設計、性能改良)中的具體功能與影響。

解題技巧

  1. 辨析狹義 vs. 廣義:題目特別強調「狹義(Narrow-sense)」,分子務必寫加性遺傳變異數 VAV_A,絕不能寫總遺傳變異數 VGV_G(廣義遺傳率)。
  2. 區分選拔差 vs. 選拔強度:選拔差(SS)帶有原始測量單位,選拔強度(ii)為無單位的標準化數值(i=S/σPi = S / \sigma_P),兩者不可混為一談。
  3. 近親係數定義精確度:閱卷評分關鍵在於有無寫出「來自共同祖先之基因拷貝」的「同源同型結合(Identical by Descent, IBD)」,而非單純的相同型態結合(Identical by State, IBS)。
  4. 基因體選拔的關鍵字掌握:必須點出「全基因體高密度 SNP 標記」、「參考群體與候選群體」、「基因體估計育種價(GEBV)」與「大幅縮短世代間距」四個關鍵詞。

【答案】

(一) 近親係數(Inbreeding Coefficient, 通常記為 FF 或 FXF_X)

  1. 定義: 個體任一基因座上的兩個對偶基因(Alleles),因其雙親具有共同祖先(Common Ancestor),而同時源自該共同祖先同一基因拷貝之機率,稱為「同源同型結合機率(Probability of Identical by Descent, IBD)」。Wright(1922)將此機率定義為近親係數 FF。

  2. 計算公式(Wright 系譜綜計法): FX=∑[(12)n1+n2+1⋅(1+FA)]F_X = \sum \left[ \left(\frac{1}{2}\right)^{n_1 + n_2 + 1} \cdot (1 + F_A) \right]

  • FXF_X:目標個體 XX 之近親係數。
  • AA:雙親之共同祖先。
  • n1n_1、n2n_2:分別為父方與母方繫結至共同祖先 AA 的世代步數(世代傳遞途徑的支數)。
  • FAF_A:共同祖先 AA 本身的近親係數。
  1. 生物學意涵與育種實務:
  • 基因純合度增加:近親交配使族群中異型結合子(Heterozygosity)頻率依 2pq(1−F)2pq(1-F) 遞減,同型結合子比例上升,能有效固定優良性狀之基因型。
  • 近親退化(Inbreeding Depression):隱性有害或致死基因純合化暴露,常導致家畜繁殖性能、抗病力、產仔數及生長存活率等適應性性狀下降。畜牧實務上通常將族群近親係數年上升率控制在 1%1\% 以下以維持永續性。

(二) 選拔強度(Selection Intensity, 通常記為 ii)

  1. 定義: 選拔留種個體的表現型平均值與原未選拔族群表現型平均值的差距稱為「選拔差(Selection Differential, SS)」。將選拔差除以該性狀之表現型標準差(σP\sigma_P),所得之無單位標準化數值即為選拔強度 ii。它代表被選個體的平均表型超越族群平均值多少個標準差。

  2. 數學公式: i=SσP=Xˉs−XˉσPi = \frac{S}{\sigma_P} = \frac{\bar{X}_s - \bar{X}}{\sigma_P}

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