114 公務人員升官等薦任 動物技術 家畜育種學 考古題詳解
第 一 題20 分
在進行遺傳估測(genetic prediction)時,我們選用選拔指數法(selection index)或 BLUP。請問 BLUP 與傳統的選拔指數法所使用的性能資料來源有何不同?(10 分)
選拔指數法個體資料會收集自哪三方面?(5 分)
何種狀況下會使用 BLUP 來獲得遺傳估測?(5 分)
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核心觀念
本題考查兩種遺傳估測方法的資料利用方式,以及選拔指數法常用的三類性能資料。
選拔指數法(selection index)是將個體及其親屬的性能資料,依各資料與育種值的遺傳關聯及資料間的共變異加權合併,形成個體的選拔指數。一般形式為:
其中 是性能資料向量, 是依遺傳與表型共變異等資料推導的權數。
BLUP(最佳線性無偏預測)則以混合模式方程式,同時估計固定環境效應並預測個體育種值。其資料可涵蓋具有性能紀錄的個體及其親屬,並透過系譜關係連結不同批次、牧場或世代的資料。
解題方法
作答時抓住資料範圍的差別:傳統選拔指數常依候選個體及其親屬的特定性能紀錄建立指數;BLUP 則可把符合分析條件的群體紀錄與系譜資訊整合起來,並在模型中校正固定環境差異。因此,BLUP 對資料不平衡、不同環境及世代間的遺傳比較,較有系統的處理方式。
性能資料的三個來源
選拔指數法所用的性能資料,通常來自以下三方面:
- 個體本身的性能紀錄:例如生長速度、產乳量或產蛋量。
- 親屬的性能紀錄:例如父母、全同胞、半同胞等親屬的紀錄。
- 後裔的性能紀錄:利用子代表現推估親代的遺傳能力,對性狀遺傳力較低或需經後裔測定的性狀尤其有用。
實際使用哪些紀錄,仍須依性狀、資料可得性及育種目標決定;三類資料不必每次都同時具備。
BLUP 與傳統選拔指數法的資料來源差異
傳統選拔指數通常依預先選定的資料來源及其相對權數進行評估,常見資料為個體本身、親屬與後裔的性能紀錄。其評估範圍常以候選個體及其相關親屬資料為主。
第 二 題20 分
雜交育種制度(crossbreeding system)是商業家畜禽生產的主流,但實施需考量的因素相當複雜,需要評估不同的雜交育種制度。
請問你會用哪些標準來評估不同的雜交育種制度?(14 分)
另外,何謂合成品種(composite breed 或 synthetic breed)?其與雜交育種制度有何差異?(6 分)
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核心觀念
本題考查的是:如何在不同雜交育種制度間作選擇,以及「合成品種」如何與持續使用不同品種交配的雜交制度區別。評估不能只看雜種優勢大小,還要同時考量品種性能互補、後代生產效率、繁殖群更新與實際執行成本。
雜種優勢(heterosis)是雜交後代相對於親本品種平均表現的優勢;品種互補(breed complementarity)則是利用不同品種的專長,使母系、父系及商品後代各自適合其生產角色。雜種優勢屬交配後代的優勢,品種互補則來自親本品種的平均遺傳差異,兩者不可混為一談。
解題方法:以「遺傳效益 × 生產效率 × 執行可行性」評估
可依序檢視下列標準:
一、商品後代的整體生產與經濟效率
比較各制度在目標生產環境中的產出、投入與收益,例如繁殖率、存活率、生長速度、飼料效率、產品品質及屠體價值;也要計入飼料、獸醫、人工、種畜或精液、母畜維持及更新等成本。
應以每單位時間、土地或投入所獲得的淨收益或生產效率作整體比較,而非只以單一性狀(如增重)判定優劣。制度的優劣取決於實際生產與市場條件。
二、雜種優勢的取得與維持
評估制度能利用多少個體、母性及父性雜種優勢,以及每代能否持續維持所需的異質合子程度。終端雜交可使商品後代取得高雜種優勢,但後代通常不留種;輪替雜交能自行生產更新母畜,卻需承受不同世代品種組成與雜種優勢的變動。
因此要看制度在整個生產循環中的雜種優勢,而不只看第一代 F₁。
三、品種互補與品種組成是否符合目標
評估所選品種是否適合分工,例如母系著重繁殖力、母性與適應力,父系著重生長、飼料利用或屠體性狀。也要確認其基因比例與當地氣候、疾病、飼養管理及飼料供應相配合。
若引入高產但不耐當地環境的品種,理論上的產量優勢可能被繁殖率、存活率或飼養成本抵銷。
四、更新母畜的來源與繁殖群維持
評估制度能否自行生產替換母畜,或必須長期向外購買。輪替雜交通常能在群內留養更新母畜;終端雜交則常須另設母系群、外購替換母畜,或搭配其他制度供應後備母畜。
外部供應若不穩定,會增加種源、健康檢疫與成本風險;自行更新雖較連續,也須有適當的配種安排及足夠繁殖群。
五、配種制度的簡易性與管理要求
比較所需品種數、配種分群、種公畜或精液供應、系譜紀錄、繁殖季節管理與人力技術。使用品種愈多、分群愈細,通常管理複雜度愈高;配種錯誤也可能使預期的品種比例與雜種優勢無法實現。
評估時須以農場實際能否長期落實為準,不能只比較遺傳理論上的最佳結果。
六、種源、繁殖率與群體規模是否足以支撐制度
確認能否持續取得具有適當遺傳水準的公畜或精液,以及產業的繁殖率是否足以供應交配系統所需的純種配種群。繁殖率較高的畜種,較容易以少量純種配種群供應大量商品雜交後代;
第 三 題20 分
何謂測試配種(test mating 或 test cross)?(4 分)
在一組測試配種試驗中,哪些因素決定了試驗結果的信賴程度?(12 分)
如何以目前的生物技術來增加測試配種的效率與正確性?(4 分)
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核心觀念
**測試配種(test mating/test cross)**是將基因型尚未確定、但具有顯性正常表現的個體,與已知為某隱性基因純合子的個體交配,藉由子代是否出現隱性性狀,判定受測個體是否帶有該隱性等位基因。家畜育種上常用來檢出遺傳缺陷的帶因者。
以單一基因、完全顯性且完全外顯的隱性遺傳缺陷為例,令正常等位基因為 、致病隱性等位基因為 ,受測個體表型正常,可能為 或 ;測試配種對象為已知的 :
- 若受測者為 ,與 交配的子代全為 ,不會出現隱性患病子代。
- 若受測者為 ,與 交配的子代各有 機率為 ,呈現隱性性狀。因此只要產生一隻確認為 的子代,即可證明受測者為帶因者。
解題方法:影響試驗結果信賴程度的因素
本題第二小題的關鍵,是分清楚「帶因者被檢出的機率」與「根據試驗結果判定帶因者狀態的把握度」。先確認親本基因型與遺傳模式,再看子代數量、子代表現判定品質,以及配種和飼養是否造成偏差。
1. 測試配種對象的基因型是否確定
測試對象應確認為隱性純合子 。若實際上不是 ,帶因者與其交配時,子代出現患病型的機率就會低於 ,甚至為零,降低檢出力。因此,測試對象的基因型確認程度是試驗信賴度的基本條件。
2. 子代數量與有效子代數
若受測者為 ,每一名子代出現 的機率為 。假設有 名存活、可判定且彼此獨立的子代,完全沒有患病型子代的機率為:
因此,至少檢出一名患病型子代的機率,也就是帶因者的檢出率為:
例如,若有 6 名有效子代:
所以,當 6 名子代皆未呈現缺陷時,在上述遺傳假設下,排除帶因者的檢出信賴度為 。子代數愈多,漏掉帶因者的機率愈低。計算時應採用實際可判定的子代數,而非僅以配種次數或受孕數代替。
3. 遺傳模式與外顯率
上述公式建立在單基因、常染色體隱性、完全外顯、子代基因型與表型判定正確等假設上。若缺陷外顯率為 ,帶因者與 配種後,每名子代被辨認為患病型的機率為 ,故 名子代均未被辨認為患病型的機率為:
外顯率低、表現程度不一,或缺陷受多基因與環境共同影響時,僅憑表型判讀會增加漏檢風險,必須納入遺傳模式與外顯率評估。
4. 子代存活與缺陷表現時間
若患病型胚胎或新生子代在檢查前死亡,或缺陷須至較晚年齡才表現,實際可觀察的患病子代數會減少。這會使「沒有觀察到患病子代」較難作為非帶因的證據。
第 四 題20 分
一隻動物的一個性狀的基因型值(genotypic value)是由其育種價(breeding value)與其基因組合值(gene combination value)一起組成的。
請你以計量性狀的基本模式,寫出一個性狀的表現型值(phenotypic value)、一個性狀族群表現平均(population mean,)、育種價、基因組合值與環境效應(environmental effect)的關係。(10 分)
並解釋育種價與基因組合值的定義。(10 分)
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核心觀念
本題考查計量性狀的表現型值分解,以及育種價與基因組合值在遺傳上的意義。個體的基因型值由加性遺傳效果與非加性遺傳效果組成;表現型值則再加上環境效應。
解題方法
計量性狀的基本模式為:
其中基因型值可拆為育種價與基因組合值:
因此,合併寫成:
其中:
- :個體的表現型值。
- :性狀族群平均。
- :育種價(breeding value)。
- :基因組合值(gene combination value)。
- :環境效應(environmental effect)。
若採用包含顯性偏差與上位作用偏差的完整分解,基因組合值可進一步寫成:
所以也可表示為:
第 五 題20 分
一個性狀的遺傳率(heritability)越高,則其任何一個性能紀錄都是其育種價的良好指標。另一方面,一個性狀的重複勢(repeatability)高,對生產能力的預測就更正確。所以遺傳率與重複勢越高越正確越好。
請問何謂遺傳率與重複勢?(10 分)
改善與提高遺傳率與重複勢的方法有哪些?(10 分)
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核心觀念
本題考查遺傳率與重複勢的定義、變異成分,以及環境管理如何影響兩個比率。兩者都是特定族群、性狀與環境條件下的參數,不能視為某個品種或性狀永遠固定不變的數值。
遺傳率有廣義與狹義之分。家畜育種以狹義遺傳率最常用,表示表型變異中由加性遺傳變異所占的比例:
其中,為加性遺傳變異,為顯性變異,為上位作用變異,為環境及殘差變異。廣義遺傳率則是遺傳變異占表型變異的比例:
狹義遺傳率可用來預測選拔反應,並衡量個體表型紀錄作為育種價指標的能力;遺傳率高表示表型差異較能反映可傳遞的加性遺傳差異,但不代表任何單一紀錄都能毫無誤差地代表育種價。
重複勢又稱重複力,是同一個體在不同時間或場合的多次性能紀錄之間的相關程度;在標準變異成分模型下,可表示為:
其中,為永久環境變異,會持續影響該個體往後的紀錄;為暫時環境與未解釋的殘差變異。重複勢反映個體的「生產能力」或持續表現,包含遺傳作用與永久環境作用;永久環境作用不會遺傳給後代。因此,在標準模型下,重複勢通常不低於狹義遺傳率。
解題方法
先辨認兩個比率的分子各包含哪些變異,再區分「改變比率本身」與「增加紀錄所提供的預測準確度」。
遺傳率的分子只計入加性遺傳變異;重複勢的分子則包含加性遺傳變異與永久環境變異。兩者的分母都是表型變異。據此可知,降低不相關的環境及殘差變異,有助於提高兩個比率;重複勢特別受暫時環境變異影響。
對可重複測量的性狀,多次紀錄能降低單次測量誤差。若每次紀錄的重複勢為 ,取 次紀錄平均值時,其平均值的重複勢為: