112 地方特考三等 衛生技術類科 生物技術學 考古題詳解
第 一 題30 分
科學家常常希望可以深入瞭解生物的眾多基因是如何共同作用,以產生和維持一個正常生物體的運作,因此發明了非常多的分子生物學相關技術,以利完成個別的研究目的。
請列舉至少四種常用來研究基因表現與功能的技術,並解釋其作用原理。
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核心觀念
基因功能研究常依研究問題分成兩類:一是測量基因是否表現、表現量及其位置;二是改變基因或其產物,再觀察細胞或個體表型的變化,以推論其功能。作答時宜列出至少四種技術,並說明各自的原理與用途。
解題方法
可依「核酸表現量、空間位置、蛋白質產物、功能干預」四個面向作答。以下列舉六種常見技術;實際研究常搭配使用,以相互驗證。
一、反轉錄定量 PCR(RT-qPCR)
先以反轉錄酶將 RNA 轉成互補 DNA(cDNA),再以目標基因專一性引子進行即時 PCR。反應中的螢光訊號隨 DNA 增幅上升,達到設定閾值所需的循環數稱為 Ct 值;Ct 越低,起始模板量通常越高。
將目標基因與內參基因比較,可估算不同樣本間的相對表現量。常用 法:
此法適合定量特定基因的 RNA 表現,但須確認 RNA 品質、引子專一性及內參基因穩定性。
二、RNA 定序(RNA-seq)
將樣本中的 RNA 轉為 cDNA 文庫,經大量平行定序後,將序列讀段比對至基因組或轉錄本,再依讀段數估算各基因的表現量。比較不同組別的讀段分布,可找出差異表現基因;亦可分析可變剪接及新轉錄本。
RNA-seq 可同時調查大量基因,屬於全轉錄體分析;其結果仍需考量測序深度、樣本品質及生物複本,重要發現可再以 RT-qPCR 驗證。
三、原位雜交(ISH;含螢光原位雜交 FISH)
將帶有標記的核酸探針與組織或細胞中的互補 RNA 或 DNA 序列進行雜交,再透過顯色或螢光訊號觀察目標分子所在位置。若探針辨識的是 RNA,可呈現特定基因在哪些細胞或組織表現;若辨識 DNA,則可用於觀察特定序列或染色體位置。
此法提供空間資訊,可補足 RT-qPCR、RNA-seq 雖能測量表現量、卻通常不直接呈現組織位置的限制。
四、報導基因分析(reporter assay)
將待研究的啟動子或調控序列接到報導基因上,例如螢光素酶(luciferase)或綠色螢光蛋白(GFP),再將構築體導入細胞。若該調控序列能促進轉錄,報導基因產物或螢光訊號便會增加。
第 二 題20 分
癌細胞會透過特殊的機制躲避免疫系統的攻擊,一旦癌細胞脫離免疫細胞的監控,癌細胞就會迅速擴張,加速癌腫瘤的發展。免疫細胞治療是目前治療癌症的方法之一,利用強化自體免疫功能來攻擊並殺死癌細胞。
請試論下列問題:
(一)癌細胞如何逃脫免疫系統的監控?
(二)T 細胞輸入療法(Adoptive T cell therapy)之種類、原理及可能副作用。
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核心觀念
本題考查腫瘤免疫學中的「癌症免疫編輯」與「過繼性 T 細胞治療」。免疫系統可辨認並清除癌細胞,但在免疫壓力下,較能逃避免疫辨識或抑制免疫反應的癌細胞會被選擇出來,逐漸形成可持續生長的腫瘤。
癌症免疫編輯常以三階段說明:
- 清除期(elimination):先天與後天免疫共同辨認、殺傷癌細胞。
- 平衡期(equilibrium):免疫系統抑制腫瘤生長,但未完全清除;腫瘤細胞逐漸累積逃脫變化。
- 逃脫期(escape):癌細胞逃離免疫控制並持續增殖。
過繼性 T 細胞治療(adoptive T cell therapy)則是取出病人的 T 細胞或腫瘤浸潤淋巴球,於體外篩選、擴增或基因改造後再輸回病人體內,以增強抗腫瘤免疫。
解題方法
本題分成兩部分作答:
(一)依「降低癌細胞可見度、關閉免疫攻擊、營造抑制環境、阻止免疫細胞進入或發揮作用」整理免疫逃脫機制。
(二)依細胞來源與辨認癌細胞的方式,說明主要 T 細胞輸入療法:腫瘤浸潤淋巴球(TIL)、T 細胞受體基因改造 T 細胞(TCR-T)與嵌合抗原受體 T 細胞(CAR-T);再對照各療法可能的毒性。
(一)癌細胞如何逃脫免疫系統的監控?
1. 降低抗原表現或抗原呈現
癌細胞可能失去或降低腫瘤抗原,或降低 MHC-I、β2-microglobulin 等抗原呈現相關分子的表現,使 CD8⁺ 細胞毒性 T 細胞較難辨認癌細胞。腫瘤內不同細胞也可能具有不同抗原,免疫系統清除帶有特定抗原的細胞後,缺乏該抗原的細胞便得以存活並擴增。
2. 啟動免疫檢查點,抑制 T 細胞
癌細胞可表現 PD-L1,與 T 細胞上的 PD-1 結合,降低 T 細胞活化與殺傷功能。腫瘤微環境中的抑制訊號亦會使 T 細胞逐漸耗竭。CTLA-4 等免疫檢查點也能限制 T 細胞活化。
3. 分泌免疫抑制因子並招募抑制性細胞
腫瘤可分泌 TGF-β、IL-10、VEGF 等因子,抑制效應 T 細胞與樹突細胞功能;也可招募調節型 T 細胞(Treg)、骨髓來源抑制細胞(MDSC)及具免疫抑制功能的腫瘤相關巨噬細胞,削弱抗腫瘤反應。
4. 逃避細胞毒性殺傷
癌細胞可增加抗凋亡訊號,或降低對穿孔素、顆粒酶及死亡受體訊號的敏感性;也可能表現 Fas 配體等分子,促使攻擊它的免疫細胞死亡。
5. 阻止免疫細胞進入腫瘤或在腫瘤內有效作用
腫瘤血管與間質屏障可能妨礙 T 細胞進入腫瘤;腫瘤微環境中的缺氧、低營養、酸性代謝物及腺苷等,也會降低 T 細胞功能。部分腫瘤同時減少樹突細胞募集或抗原呈現,降低腫瘤特異性 T 細胞的啟動。
(二)T 細胞輸入療法之種類、原理及可能副作用
1. 腫瘤浸潤淋巴球治療(TIL therapy)
**原理:**從腫瘤組織取出已浸潤腫瘤的淋巴球,篩選或擴增具有抗腫瘤活性的 T 細胞,並常搭配淋巴球清除性前處理與細胞激素支持,再將細胞輸回病人體內。TIL 可辨認腫瘤細胞呈現在 MHC 上的腫瘤抗原。
第 三 題20 分
不同形式與成分的 COVID-19 疫苗,包括 mRNA 疫苗,緩解了新冠肺炎的疫情。
請敘述 mRNA 疫苗製備之原理,並比較 mRNA 疫苗與傳統疫苗和 DNA 疫苗之優缺點。
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核心觀念
本題考查的是核酸疫苗如何利用人體細胞製造抗原,以及 mRNA 疫苗、DNA 疫苗與傳統疫苗在抗原來源、製備方式、免疫反應與安全性上的差異。
mRNA 疫苗不直接注入病毒抗原,而是將編碼目標抗原的信使 RNA(mRNA)送入細胞質,使細胞依據 mRNA 合成抗原蛋白。抗原經細胞內處理後,可透過主要組織相容性複合體(MHC)呈現,誘發抗體與 T 細胞免疫反應。
解題方法
回答時依序掌握兩個重點:
- 說明製備流程:從選定抗原基因、設計 mRNA,到體外轉錄、純化與脂質奈米顆粒包覆。
- 依疫苗平台比較:比較抗原如何產生、是否需要進入細胞核、製備速度、免疫效果、安全性及保存需求。
mRNA 疫苗製備原理
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選定抗原與設計序列 選定病原體中可引發保護性免疫的抗原,例如 SARS-CoV-2 的棘蛋白(spike protein),設計能編碼該抗原的 mRNA 序列。
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建立 DNA 模板 製備含有目標序列及轉錄調控區的 DNA 模板,供體外轉錄使用。模板可由質體 DNA 等方式提供。
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體外轉錄與 mRNA 修飾 以 DNA 為模板進行體外轉錄(in vitro transcription),製得目標 mRNA。成熟 mRNA 通常包含 5′ 端帽結構、適當的非轉譯區及 poly(A) 尾,以提升穩定性並促進翻譯。部分疫苗會使用修飾核苷,以降低不必要的先天免疫辨識、改善 mRNA 的穩定性與蛋白質表現。
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純化與品質檢驗 移除未反應原料、酵素、DNA 模板及可能的雙股 RNA 等雜質,並確認 mRNA 的完整性、純度與含量。
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脂質奈米顆粒包覆 mRNA 容易被核酸酶分解,也不易自行穿過細胞膜,因此以脂質奈米顆粒(lipid nanoparticle, LNP)包覆,協助保護 mRNA、進入細胞並釋放至細胞質。
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細胞內抗原表現與免疫誘發 LNP 進入細胞後釋出 mRNA,細胞質中的核糖體將其翻譯成抗原蛋白。抗原可被細胞處理並呈現,誘發抗體反應及 T 細胞反應。mRNA 在細胞內逐漸被分解,不需要進入細胞核即可表現抗原。
mRNA 疫苗、傳統疫苗與 DNA 疫苗比較
| 比較項目 | mRNA 疫苗 | 傳統疫苗 | DNA 疫苗 |
|---|---|---|---|
| 抗原來源 | 細胞讀取注入的 mRNA,製造抗原 | 直接給予病原體、病原體成分或其製成的抗原 | 細胞讀取 DNA,再轉錄、翻譯製造抗原 |
第 四 題30 分
美國食品藥物管理局(FDA)至今核准了超過 100 種用來治療各種疾病的單株抗體藥物。
請試論下列問題:
(一)製造單株抗體用來治療疾病之方法原理與其優缺點?
(二)哪幾種型態之單株抗體常用來治療癌症?
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核心觀念
單株抗體(monoclonal antibody, mAb)是由單一 B 細胞克隆或其衍生細胞株製造的一群抗體,具有相同的抗原結合特異性,能辨認同一抗原上的特定表位。題目分成兩個考點:一是如何取得並大量製造具治療用途的單株抗體;二是治療癌症時常見的抗體形式。
傳統製備方法是雜交瘤技術;現代治療性抗體則常結合抗體工程、噬菌體展示、轉殖動物或重組表現技術,以提高抗體的人源化程度、產量與臨床適用性。
解題方法
(一)按「免疫取得特異性 B 細胞 → 永生化 → 篩選單株 → 擴增製造」說明雜交瘤技術,再以其優缺點作答。治療用抗體另須指出鼠源抗體在人體可能引發免疫反應,因此發展出嵌合、人源化及全人抗體。
(二)「型態」可從抗體的作用形式分類,說明未偶聯抗體、抗體藥物偶聯物及雙特異性抗體;若補充癌症抗體的人源化程度分類,可使答案更完整。兩種分類依據不同,作答時應明確區分。
(一)製造治療用單株抗體的方法原理與優缺點
1. 雜交瘤技術的原理與步驟
- 免疫動物:以目標抗原免疫小鼠,誘發能辨認目標抗原表位的 B 細胞,常取脾臟細胞作為來源。
- 細胞融合:將脾臟 B 細胞與具增殖能力、但本身不分泌目標抗體的骨髓瘤細胞融合,形成雜交瘤(hybridoma)。常用 PEG 促進融合。
- 選擇融合細胞:在 HAT 培養基中篩選。未融合的骨髓瘤細胞因缺乏 HGPRT,在 HAT 培養基中無法存活;未融合的 B 細胞雖有相關代謝能力,但壽命有限;具有兩者特性的雜交瘤則能持續存活與增殖。
- 篩選並單株化:檢測各株培養液中的抗體是否能與目標抗原特異性結合,再以有限稀釋等方法取得單一細胞來源的克隆,並確認其特異性與功能。
- 擴增與製造:選定穩定株後進行培養、擴增與抗體純化。治療用製程須進一步控制抗體的純度、效價、穩定性與批次一致性。
雜交瘤的核心在於結合兩種細胞的特性:B 細胞提供抗體特異性,骨髓瘤細胞提供持續增殖能力。
2. 優點
- 能取得對特定抗原表位具高度專一性的抗體,適合製造性質一致的單株抗體。
- 雜交瘤可長期培養並持續分泌抗體,建立細胞株後便於穩定供應。
- 篩選後可比較不同克隆的結合能力與生物活性,選出適合治療用途的抗體。
3. 缺點與改良方向
- 鼠源抗體的免疫原性:傳統小鼠雜交瘤產生的鼠源抗體進入人體後,可能引發人抗鼠抗體反應(HAMA),造成抗體較快被清除、療效降低,並增加不良反應風險。
- 靶點與功能限制:若目標抗原不易誘發適當的免疫反應,或抗體雖能結合但無法產生所需功能,仍難以得到理想治療抗體。