113 高普考高考二級 農業技術 作物育種學 考古題詳解

113 年・高普考・高考二級・農業技術
試題代碼 作物育種學

第 一 題30 分

請敘述下列名詞之意涵與其在育種之應用或現象。(每題 5 分,共 30 分)

(一) core collection

(二) synthesis variety

(三) epigenetics

(四) multiline variety

(五) speeding breeding

(六) double haploid

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核心觀念與解題方法

本題考查作物育種中六個常見名詞,涵蓋種原保存與利用、族群品種、基因表現調控、病害抗性配置,以及加速世代與固定純系的方法。作答時,每個名詞依序交代「定義、形成或作用方式、育種上的用途或現象」,即可完整呈現重點。

(一)core collection(核心種原)

**意涵:**核心種原是從大型種原庫中,依據來源、形態、農藝性狀及遺傳標記等資料,選出數量較少、但力求保留原種原庫主要遺傳多樣性與變異範圍的一組代表材料。

**育種應用:**核心種原可降低種原評估與管理的時間、空間及成本,方便育種者快速篩選具有抗病、耐逆境、品質或特殊農藝性狀的材料,並作為親本選拔與遺傳研究的起點。核心種原是大型種原庫的代表性子集,不等於取代原始種原庫;若核心樣本選取不當,稀有等位基因仍可能未被納入。

(二)synthesis variety(合成品種)

**意涵:**合成品種是將數個具有優良一般組合力、且在生殖上相容的自交系、品系或其他親本混合,讓親本彼此隨機交配後形成的族群品種。其遺傳組成以多個親本的基因重組為基礎,通常保留一定程度的遺傳變異。

**育種應用:**在異交作物中,育種者可選取一般組合力佳的親本建立合成品種,利用親本間的互交與基因重組發揮雜種優勢,並以族群方式供應種子。合成品種可以經由隔離繁殖維持,但因為族群仍會分離與重組,後代不會像高度純合的自交系那樣整齊一致,繁殖時須注意外來花粉污染及族群組成變動。

(三)epigenetics(表觀遺傳學)

意涵:表觀遺傳學研究在DNA 鹼基序列未改變的情況下,基因表現如何受到可遺傳或可維持的調控。常見機制包括 DNA 甲基化、組蛋白修飾及小 RNA 調控;這些機制會影響染色質狀態,進而改變基因的活化或抑制程度。

**育種現象與應用:**相同或相近的基因型,可能因表觀遺傳狀態不同而呈現不同性狀;環境刺激也可能引發表觀變化,部分變化可跨細胞分裂維持,少數可跨世代傳遞。育種上可研究其對開花期、逆境反應、產量或品質的影響,並評估穩定性與遺傳性。表觀遺傳變化不是 DNA 序列突變,且並非每一種表觀狀態都能穩定遺傳。

(四)multiline variety(多系品種)

**意涵:**多系品種是由數個在主要農藝性狀上高度相似、但各自帶有不同抗病基因的近等基因系混合而成的品種。各系通常有相近的株高、成熟期及外觀,使田間整體表現接近單一品種。

**育種應用與現象:**若病原菌族群能克服其中某一系的抗性,其他帶有不同抗病基因的系仍可抵抗病害,因而降低病害在田間快速擴展及造成重大損失的風險。多系品種的效果依賴各系對應的抗病基因、混合比例及病原菌族群特性;若多個抗性基因都已遭病原菌克服,防病效果便會下降。

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第 二 題20 分

蕎麥因其營養價值高與多元加工產品,受到消費者喜愛,近年來受到重視,加上少肥、耐旱、好種植的低投入栽培管理,臺灣本土蕎麥正興起,栽培面積逐年增加。

在臺灣的蕎麥可分為哪兩種?分別詳述如何以育種增進產量。

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核心觀念

臺灣栽培的蕎麥主要分為甜蕎(普通蕎麥,Fagopyrum esculentum)與苦蕎(韃靼蕎麥,F. tataricum)。本題關鍵在於兩者的授粉與繁殖特性不同,因此增產育種的著力點也不同:

  • 甜蕎是異型花柱、自交不親和作物,主要依靠昆蟲在不同花型間授粉。
  • 苦蕎通常是同型花柱、自交親和作物,可自花授粉並形成較穩定的自交後代。

產量可概括為單位面積內植株數、每株有效果數、每果粒重等構成因素的綜合表現;育種上須兼顧結實率、粒重、成熟整齊度與不落粒性。

解題方法

先辨認兩種蕎麥的繁殖系統,再逐一連結其低產原因與可採用的育種途徑:

  1. 甜蕎的結實受異花授粉與昆蟲媒介影響,增產重點是改善授粉結實及選育高產、穩產族群。
  2. 苦蕎可自交結實,較容易固定有利基因,增產重點是純系選拔、雜交後代選拔及產量構成性狀改良。

一、甜蕎:改善異花授粉與結實,選育高產族群

甜蕎有兩種花型:長花柱、短雄蕊的 pin 型,以及短花柱、長雄蕊的 thrum 型。兩型間具有異型自交不親和性,同型花粉通常不能有效受精,須仰賴不同花型間的授粉;昆蟲活動不足、花期不一致或環境不利授粉,都會降低結實率。

增產育種可採下列方向:

  • **選拔高結實、高產個體與族群:**在適合的授粉條件下進行田間選拔,重點觀察有效分枝、每株成熟果數、千粒重、成熟整齊度及不落粒性,再以族群選拔或循環選拔累積有利基因。
  • **改善花期與花型協調:**選育花期集中、不同花型開花期相互配合的材料,促進有效異花授粉;田間繁殖與品系比較時,應確保兩種花型都能參與授粉。
  • **利用雜種優勢:**甜蕎為異交作物,可透過適當親本組合選育高產雜交族群或雜交種;
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第 三 題25 分

農業部於今年(民國 113 年)執行數位育種,將 multi-omics(多體學)產生的巨量資料應用於育種,以提升育種效率。

試述不同體學的含意及其分析方法,以獲得巨量資料,以及相互之間的關係。闡述其中兩種與育種最為相關之體學,以及如何應用?

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核心觀念

本題考查多體學(multi-omics)的基本概念、各類體學取得與分析巨量資料的方法,以及如何把不同層次的生物資訊整合到作物育種。作答時先依「由基因到性狀」說明各體學,再交代資料間的關係,最後聚焦於與育種決策直接相關的基因體學與表現型體學。

體學(omics)是以整體、高通量方式研究某一類生物分子或性狀的分析方法。相較於逐一檢測單一基因或代謝物,體學可在全基因組、全轉錄體或全代謝物的尺度取得大量資料;經過品質控管、統計分析與生物資訊整合後,可用來解析性狀形成機制及預測育種價值。

各類體學的含意與分析方法

體學研究對象與含意主要資料取得及分析方法
基因體學(genomics)研究生物全部 DNA 序列及其變異,包括單核苷酸多型性(SNP)、插入缺失及結構變異。全基因組定序(WGS)、重定序、基因分型晶片、簡化基因組定序(如 GBS);經讀序比對、變異偵測、品質控管與族群結構分析,取得 SNP 等基因型資料。
轉錄體學(transcriptomics)研究特定組織、發育時期或環境下,RNA 的種類與表現量,反映基因表現狀態。RNA 定序(RNA-seq)或微陣列;讀序比對或轉錄本組裝後,以標準化表現量及差異表現分析找出受發育或環境影響的基因。
蛋白質體學(proteomics)研究細胞或組織中蛋白質的種類、豐度及修飾狀態;蛋白質是許多生物反應的直接執行者。液相層析串聯質譜(LC-MS/MS)、二維電泳及蛋白質晶片;進行蛋白質鑑定、定量與差異分析。
代謝體學(metabolomics)研究生物體內小分子代謝物的整體組成與含量,呈現基因、環境及生理反應的綜合結果。氣相或液相層析質譜(GC-MS、LC-MS)、核磁共振(NMR);經峰值擷取、代謝物鑑定、定量與多變量分析,辨識差異代謝物及代謝路徑。
表觀基因體學(epigenomics)研究不改變 DNA 序列、卻影響基因表現的全基因組調控狀態,如 DNA 甲基化、組蛋白修飾及染色質開放程度。亞硫酸氫鹽定序、ChIP-seq、ATAC-seq;分析修飾位點、蛋白質結合區或開放染色質區域。
表現型體學(phenomics)以高通量方式量測個體或族群的多項表現型,包含生長、產量、形態、生理及對逆境的反應。田間或溫室感測器、影像分析、無人機與光譜感測;經影像分割、特徵萃取及統計或機器學習分析,取得大量且可重複的性狀資料。

體學間的關係

各類體學描述的是生物系統不同層次,並非彼此獨立。基因體提供遺傳變異的基礎;表觀基因體及轉錄體反映基因如何受到調控與表現;蛋白質體呈現基因產物及其作用狀態;代謝體反映生化反應的結果;表現型則是基因、環境及管理共同作用後可觀察到的性狀。

可用下列方向理解其整合關係:

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第 四 題25 分

張三和李四以 102 個國內外常見水稻品種,調查第一期作和第二期作的抽穗期和 6 個抽穗期基因之基因型,分析抽穗期基因遺傳歧異度在臺灣栽培環境下與抽穗日數的關係。分別摘錄臺灣和日本四個水稻品種,此 6 個抽穗期之基因型和抽穗日數如下:

品種HD6EHD1DTH8HD1RFT1GHD7抽穗期(I)抽穗期(II)
桃園 3 號IIIIIIIIII9562
臺中 194 號IIIIIXVIIIII9663
臺南 11 號IIIIXVIIIII9569
高雄 145 號IIIIIIIVII9363
良稔IIIIVIII7550
日本晴IIIIIII7554
越光IIIIIVIII7550
千代錦IIIIIIIII8750

請回答下列問題:

(一) 分析四個臺灣品種之抽穗期基因型與抽穗期之關係。(5 分)

(二) 分析此四個臺灣品種與日本品種在品種間的抽穗期差異,主要是受哪些基因的調控?(5 分)

(三) 若想育成不同臺南 11 號抽穗期的近同源系,請說明哪個日本品種最適當,原因為何?並敘述分子標誌選育的過程。(15 分)

🖼️ 本題原卷含圖表。基於試題來源之版權考量,本站不轉載原卷影像; 題目文字已完整轉錄,圖表請自行參閱考選部公告之試題原檔。

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核心觀念

水稻抽穗期是受多基因與環境共同影響的數量性狀。題目列出的 HD1、HD6、EHD1、DTH8、RFT1、GHD7 基因參與光週期反應及開花訊號調控;各基因間也會交互作用。EHD1 可促進下游開花訊號,RFT1 是促進抽穗的開花素基因;HD1、HD6、DTH8、GHD7 則依光照長短及基因組合影響抽穗時間。

表中的羅馬數字代表不同基因型,不是等位基因效應強弱的排序。不能只憑「I、II、XVIII」直接判定哪個基因型促進或延遲抽穗,應比較基因型與實際抽穗日數的關聯。

解題方法

先分開比較一期作與二期作,再找臺灣品種和日本品種間一致的基因型差異。判斷近同源系的親本時,則優先選擇抽穗期差異明顯、且在非目標抽穗期基因上與臺南 11 號較相近的供體品種。

(一)四個臺灣品種的基因型與抽穗期關係

一期作四品種抽穗期為 93–96 日,差距僅 3 日。儘管 HD6、DTH8、HD1 的基因型不完全相同,抽穗日數仍相近,顯示一期作下,這四個品種的基因型差異未造成明顯的抽穗期差距。

二期作抽穗日數為 62–69 日,品種間差距增至 7 日。臺南 11 號為 69 日,是四品種中最晚者;其基因型為 HD6 I、DTH8 I、HD1 XVIII。桃園 3 號與高雄 145 號均為 62–63 日,HD6、DTH8 都是 II,HD1 則分別為 II、IV;臺中 194 號的 HD1 也是 XVIII,但抽穗期為 63 日。因此,表中沒有呈現單一基因型與抽穗日數的一對一關係,應以多基因組合及基因交互作用解釋。

四個臺灣品種都具有 EHD1 II、RFT1 I、GHD7 I,這些共同基因型不足以解釋品種間抽穗差異;變異主要落在 HD6、DTH8、HD1 等基因組合。特別是臺南 11 號二期作較晚,但臺中 194 號雖同為 HD1 XVIII,二期作卻早 6 日,說明不能只將差異歸因於 HD1。

(二)臺灣品種與日本品種的抽穗期差異

四個臺灣品種的一期作為 93–96 日,二期作為 62–69 日;日本品種一期作為 75–87 日,二期作為 50–54 日。整體而言,日本品種較早抽穗。

表中最一致的差異是 EHD1:臺灣品種均為 II,日本品種均為 I。HD1 也呈現顯著差異:臺灣品種為 II、IV 或 XVIII,日本品種為 I、II 或 VI。HD6 在日本四品種均為 II,臺灣品種則有 I、II 兩型。相較之下,RFT1 與 GHD7 在兩地品種中均為 I,不能解釋這組品種的差異;DTH8 在臺日品種間都有 I、II,單靠此基因也無法說明整體差距。

因此,依表中比較,臺灣與日本品種的抽穗期差異主要與 EHD1、HD1、HD6 的基因型差異相關,並受到其他基因組合及栽培季節影響。

(三)近同源系親本選擇與分子標誌選育

親本選擇:良稔。

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