113 調查局特考三等 醫學鑑識組 遺傳學 考古題詳解
第 一 題40 分
請說明下列遺傳名詞之意涵:(每小題 8 分,共 40 分)
(一) 比較基因組雜交(comparative genomic hybridization)
(二) 基因組編輯(genome editing)
(三) 基因組印記(genomic imprinting)
(四) 次世代基因定序(next generation sequencing)
(五) 遺傳嵌合性(genetic chimerism)
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核心觀念
本題考查五種遺傳學名詞的定義、分析原理與典型應用。作答時宜交代「研究對象或操作方式、得到的遺傳資訊,以及其限制或重要特徵」,避免只列出中文譯名。
解題方法
依序掌握各名詞的辨識重點:比較基因組雜交(CGH)看 DNA 拷貝數變化;基因組編輯看定點修改 DNA;基因組印記看親本來源造成的基因表現差異;次世代基因定序(NGS)看大量平行定序;遺傳嵌合性則看同一個體內存在不同基因型的細胞族群。
(一)比較基因組雜交(comparative genomic hybridization, CGH)
CGH 是比較受測者 DNA 與正常參考 DNA 在各染色體區段上的相對拷貝數,以偵測基因組範圍內 DNA 增加或減少的技術。傳統 CGH 將兩者分別以不同螢光標記,再共同雜交至正常中期染色體;沿染色體測量兩種螢光訊號的相對強度,即可判讀拷貝數變化。
微陣列式比較基因組雜交(array CGH)則將 DNA 樣本與參考 DNA 雜交至含有大量基因組探針的微陣列,依各探針的訊號比值尋找染色體區段的缺失或重複。其解析度通常高於傳統 CGH,可用於偵測微缺失、微重複等拷貝數變異。
CGH 主要偵測 DNA 劑量變化,通常不能辨識平衡性染色體轉位或倒位,也不能單靠拷貝數訊號判定變異來自父方或母方。array CGH 通常亦不能直接偵測單一核苷酸變異。
(二)基因組編輯(genome editing)
基因組編輯是利用可辨識特定 DNA 序列的工具,在基因組預定位置造成切割或其他形式的 DNA 改變,進而達成序列刪除、插入、置換或調控基因表現的技術。常見工具包括 CRISPR-Cas 系統、鋅指核酸酶(ZFN)及類轉錄活化因子核酸酶(TALEN)。
以 CRISPR-Cas9 為例,導引 RNA 負責辨識目標序列,Cas9 核酸酶在指定位置切割 DNA。細胞可透過非同源末端接合修復斷裂,常產生小型插入或缺失,造成基因功能失活;若提供含有指定序列的修復模板,則可透過同源導向修復導入特定變化。
基因組編輯可用於基礎研究、疾病模型建立及潛在治療應用。重要限制包括非預期位置的編輯(脫靶效應)、目標位置編輯效率不一,以及不同細胞未被一致編輯所造成的鑲嵌現象。
(三)基因組印記(genomic imprinting)
基因組印記是指部分基因的表現受到親本來源影響:同一基因由父方或母方遺傳時,可能只有其中一方來源的等位基因表現,另一方來源的等位基因則受到抑制。這種親本來源特異性的表現通常與 DNA 甲基化及染色質修飾等表觀遺傳調控有關,而不是因為父方與母方的 DNA 序列必然不同。
第 二 題20 分
請說明親子鑑定之核酸檢測方法。說明內容應包括:
(一) 常見之基因檢測標的。
(二) 主要實驗進行流程。
(三) 分析方法,以推論兩個測試檢體之親子關係。
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核心觀念
親子鑑定主要利用子代在各基因座各有一個等位基因來自生父、一個來自生母的遺傳規則。比較子代與待測父親在多個高度多型性基因座的基因型,先判斷是否有遺傳不相容,再以統計方法評估觀察結果對親子關係假說的支持程度。
實務上以**常染色體短串聯重複序列(autosomal STR)**為主要檢測標的。多個基因座的證據合併後,可計算累積親權指數(CPI),或直接以概似比(likelihood ratio, LR)表達證據強度。DNA 型別相符不等於單憑「配對幾個相同型別」即可證明親子關係;仍須考量族群等位基因頻率與合理的對照假說。
(一)常見之基因檢測標的
- 常染色體 STR:STR 是由短序列單位重複多次形成的多型性標記。每一基因座通常檢測兩個等位基因,分別由雙親遺傳。其多型性高、可用多重 PCR 同時擴增多個基因座,為親子鑑定的核心標的。
- 性染色體 STR:必要時可輔助使用。Y-STR 可用於父系男性間的親緣分析;X-STR 可在特定家系與親緣問題中提供額外資訊。這些標記受限於性別與家系遺傳方式,不能取代常染色體 STR 的主要分析。
- 粒線體 DNA(mtDNA):由母系遺傳,較適合判斷母系血緣或分析核 DNA 不足的檢體;其型別通常不能單獨區分同一母系中的個體,也不適合作為一般雙親親子鑑定的主要標記。
- 其他標記:SNP 等核酸多型性標記亦可用於特定檢測平台或疑難案件;常規親子鑑定仍以多座常染色體 STR 分析為主。
(二)主要實驗進行流程
- 檢體採集與身分確認:採集子代及待測親屬檢體,常用口腔頰黏膜拭子或血液。具法律用途的案件須確認受檢者身分、採樣程序與檢體保管鏈,避免檢體標示錯誤或污染。
- DNA 萃取與定量:自細胞取得 DNA,去除蛋白質等雜質;再測定 DNA 濃度與品質,供後續 PCR 使用。
- 多重 PCR 擴增:以螢光標記引子,同時擴增多個 STR 基因座。PCR 會複製目標區段;STR 重複次數不同,造成擴增片段長度不同。
- 片段分離與基因分型:常以毛細管電泳依片段長度分離螢光產物,再以內部尺寸標準及等位基因梯判讀各基因座的等位基因型別。
- 品質檢查與必要複驗:檢視陽性、陰性及等位基因梯等品管結果,確認訊號符合判讀規則。若出現不一致、訊號不足或疑似突變等情形,應檢查檢體與技術因素,並視需要複驗或增加基因座。
- 遺傳判讀與統計計算:先比較子代、已知母親(如有)及待測父親的基因型,判斷每座基因座的遺傳相容性,再計算各座親權指數並合併。
(三)分析方法:推論兩個測試檢體之親子關係
1. 先判斷遺傳相容性
有母親檢體時,先由子代基因型與母親基因型辨認子代的必然父源等位基因。例如子代基因型為 、母親為 ,則子代的 為必然父源等位基因;待測父親必須能提供 ,才符合該座遺傳傳遞。
若未採母親檢體,則須比較子代與待測父親型別,並依可能的遺傳傳遞方式判讀;資訊較少,親權指數的計算也須採用相應模型。
2. 排除與突變考量
第 三 題20 分
請說明粒線體基因之遺傳模式與常見之基因檢測方法。並舉例一個粒線體遺傳性疾病,說明其基因檢測結果與嚴重度之關係。
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核心觀念
本題考粒線體 DNA(mtDNA)的遺傳特性、常見檢測方式,以及異質性(heteroplasmy)如何影響疾病嚴重度。粒線體有自己的基因組,主要由母親傳給子女;其突變比例會因細胞與組織而異,因此檢測結果須一併考慮檢體來源及突變異質性。
解題方法
回答時依序掌握三個層次:
- 說明 mtDNA 的遺傳模式與其不同於核基因的特點。
- 整理常見檢測方法及各自適用範圍。
- 以一種疾病說明突變比例、組織分布與臨床嚴重度的關聯。
一、粒線體基因的遺傳模式
粒線體遺傳通常呈現母系遺傳:卵子提供胚胎絕大多數的細胞質與粒線體,因此帶有 mtDNA 變異的母親可將其傳給兒女;父親通常不會將 mtDNA 傳給子女。母親的兒子與女兒都可能受影響,但只有女兒能再將 mtDNA 傳給下一代。
mtDNA 有以下重要特性:
- 多拷貝:每個細胞含有許多粒線體,每個粒線體又可含多份 mtDNA。
- 同質性與異質性:若細胞內 mtDNA 都是正常型或都帶相同變異,稱為同質性(homoplasmy);若正常型與變異型 mtDNA 並存,稱為異質性(heteroplasmy)。
- 隨機分配與瓶頸效應:細胞分裂時,mtDNA 隨機分配至子細胞;卵子形成期間也會出現粒線體瓶頸效應。因此,同一家族成員、同一個人的不同組織,變異比例均可能不同。
- 閾值效應:變異型 mtDNA 累積至一定比例,並影響組織能量需求時,才會出現臨床表現。高能量需求組織,如腦、骨骼肌、心肌及視神經,常較易受影響。
因此,母系遺傳表示家族傳遞方向具有特徵,並不代表母親與子女的症狀或嚴重度必然相同。
二、常見基因檢測方法
- 聚合酶連鎖反應(PCR)及 Sanger 定序:適合檢測已知或懷疑的特定 mtDNA 變異;若只針對少數位置,不適合排除整個 mtDNA 基因組的其他變異。
- 次世代定序(NGS):可檢測較完整的 mtDNA 序列及多個變異,並估計異質性比例;低比例變異的判讀仍受定序深度、分析流程及檢體品質影響。
- 限制酶片段長度多型性分析(RFLP)或等位基因特異性 PCR:可針對已知變異進行檢測,方法簡便,但檢測範圍受限於設計的目標變異。
第 四 題20 分
請分別說明以下染色體異常(chromosomal abnormality)之分析方法(需說明個別方法之實驗原理與主要流程):
(一) 第一對染色體缺少一條。
(二) 第一對染色體之某基因發生點突變(point mutation)。
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核心觀念
本題要依異常的尺度選擇分析方法:
- 第一對染色體缺少一條:屬於染色體數目異常,稱為單體型(monosomy)。一般體細胞由 46 條染色體組成,若第一號染色體少一條,核型為 45 條,記作 45,XX,-1 或 45,XY,-1。
- 第一對染色體之某基因發生點突變:屬於基因層級的序列變異,須分析該基因的 DNA 序列;常用方法為聚合酶連鎖反應(PCR)後接 Sanger 定序。
染色體核型分析觀察染色體數目與帶型,適合偵測整條染色體的增減;PCR 與定序則檢視特定 DNA 片段中的鹼基序列,適合偵測點突變。兩者分析標的不同,不能只靠其中一種方法同時完成兩種問題。
解題方法
(一)第一對染色體缺少一條:核型分析
實驗原理: 核型分析(karyotyping)利用細胞分裂中期染色體高度凝縮、形態較容易辨識的特性,經染色後依染色體大小、著絲點位置及帶型排列,逐一計數並辨認各號染色體。常用 G 顯帶染色:以胰蛋白酶處理染色體,再以 Giemsa 染色,使各染色體呈現具特異性的明暗帶紋。
主要流程:
- 採集細胞:取得含有細胞核的檢體,例如周邊血淋巴球。
- 細胞培養:使細胞進入分裂週期;周邊血淋巴球通常以植物血球凝集素刺激分裂。
- 阻斷於中期:加入秋水仙素或類似藥物,抑制紡錘體形成,使分裂細胞停留於中期。
- 低張處理與固定:低張液使細胞膨脹、染色體分散,再以甲醇與醋酸固定。
- 製片及 G 顯帶:將細胞滴於玻片,使染色體展開,經酵素處理及 Giemsa 染色。
- 顯微鏡觀察與核型判讀:計數多個中期細胞,依帶型辨認染色體。若為非嵌合的第一號染色體單體,應見每個被分析細胞僅有一條第一號染色體,總數為 45 條。
若核型為女性,可表示為 45,XX,-1;若核型為男性,可表示為 45,XY,-1。若不同細胞的結果不一致,須考慮嵌合現象並分析足夠數量的細胞。
染色體微陣列(CMA)也能偵測全染色體的拷貝數減少;但若題目要求呈現染色體的數目與形態,傳統核型分析是直接且合宜的作答方法。