108 地方特考三等 衛生技術 生物技術學 考古題詳解

108 年・地方特考・三等・衛生技術
試題代碼 生物技術學

第 一 題20 分

請說明何謂定位點突變(Site-Directed Mutagenesis)技術?並列舉兩種常用的定位點突變方法。另說明定位點突變技術在生物技術上之應用。

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核心觀念

定位點突變(Site-Directed Mutagenesis,亦稱定點突變)是指在已知 DNA 序列的位置,依實驗目的引入特定核苷酸改變的技術。改變可包括單一鹼基替換、插入或缺失,進而改變基因產物的胺基酸序列、基因表現或調控功能。

此技術的關鍵是「預先指定突變位置與型式」,不同於隨機誘變後再篩選突變株。設計突變時,通常先確認目標序列,再製作含有目標改變的引子或 DNA 片段,將突變導入載體或基因組,最後以定序確認。

解題方法

作答可依序說明三件事:先下定義,再列出兩種常用方法及其基本原理,最後連結到生物技術應用。方法不必詳列每個操作細節,但應指出突變如何被帶入 DNA,以及如何確認突變成功。

常用方法一:重疊延伸 PCR(Overlap Extension PCR)

分別以含目標突變的互補引子,擴增基因的兩個相鄰片段。這兩片段在突變位置具有重疊序列,混合後可藉由重疊區互補配對與延伸,形成含突變的完整基因;再以外側引子擴增全長產物,接入載體並定序確認。

常用方法二:全質體 PCR/QuikChange 法

設計一對互補引子,使目標突變位於引子中間。以此引子對含有目標基因的質體進行 PCR,產生帶有突變的新生質體 DNA。反應後以限制性內切酶 DpnI 消化含甲基化的親代質體,保留新合成的突變質體,再轉形細菌並以定序確認。

其他定位點突變方法還包括以寡核苷酸置換片段、使用重組或基因編輯系統導入指定變異等;但作答列出兩種並說明原理即可。

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第 二 題20 分

何謂噬菌體治療(Phage therapy)?並說明噬菌體治療之優缺點及目前的進展。

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核心觀念

噬菌體治療(phage therapy)是利用能感染細菌的病毒——噬菌體(bacteriophage)——來控制或清除細菌感染。治療通常選用裂解型噬菌體:噬菌體辨識並附著於特定細菌,將核酸注入細胞、利用細菌的細胞機制複製,最後使細菌裂解死亡並釋出新噬菌體。

噬菌體的宿主範圍通常較窄,常只能感染特定菌種或菌株,因此治療前須確認致病菌,並測試候選噬菌體是否能有效感染該菌。臨床上可使用單一噬菌體,也可使用多種噬菌體組成的混合製劑(phage cocktail),有時搭配抗生素治療。

解題方法

本題是申論題,可依「定義與作用原理 → 優點 → 缺點與限制 → 臨床及研究進展」作答。先說明噬菌體如何選擇性殺菌,再從宿主專一性、抗藥性及微生物相容性等角度分析優缺點,最後區分目前的臨床應用與仍待克服的問題。

一、治療方式與作用原理

  1. 分離並鑑定病原菌:取得患者感染部位的細菌,確認菌種或菌株。
  2. 篩選有效噬菌體:以宿主範圍測試或斑塊形成等方法,確認噬菌體能感染並裂解該菌。
  3. 製備治療用噬菌體:可採單一噬菌體或噬菌體雞尾酒,並進行純化與品質控制。
  4. 給予治療:依感染部位採局部、口服或靜脈等途徑;嚴重或難治性感染常考慮與抗生素併用。
  5. 監測治療反應:評估細菌量、臨床症狀及細菌是否產生噬菌體抗性,必要時調整噬菌體組成。

二、優點

  • 具高度專一性:能針對特定病原菌作用,對正常菌相的影響通常較廣效抗生素小。
  • 可用於抗藥性細菌感染:噬菌體的感染與裂解機制不同於抗生素,因此某些對抗生素具抗性的細菌仍可能對噬菌體敏感。
  • 具有增殖能力:在適當宿主與感染部位中,噬菌體可複製並增加數量。
  • 可組合或更新製劑:以多種噬菌體組成雞尾酒,或依病原菌株篩選與調整,有助於擴大涵蓋範圍、降低細菌逃脫機會。
  • 有機會與抗生素產生互補作用:併用治療可利用不同作用機制,作為難治性感染的治療策略。

三、缺點與限制

  • 宿主範圍狹窄:同一噬菌體未必能感染同一菌種的所有菌株,治療前須進行病原鑑定與敏感性測試。
  • 細菌可能產生抗性:細菌可藉由改變噬菌體受體等方式逃避感染;
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第 三 題20 分

請說明下列各種幹細胞的來源及可能用途:(每小題 5 分,共 20 分)

(一) 胚胎幹細胞(Embryonic Stem Cells; ESCs)

(二) 成體幹細胞(Adult Stem Cells; ASCs)

(三) 誘導性多功能幹細胞(Induced Pluripotent Stem Cells; iPSCs)

(四) 治療性複製(Therapeutic Cloning or Somatic Cell Nuclear Transfer)

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核心觀念

本題考查不同幹細胞的來源、分化潛能與醫學用途。作答時應逐一說明細胞如何取得、可分化的範圍,以及在研究或治療上的應用;其中「治療性複製」是取得幹細胞的方法與策略,並非一種天然存在的幹細胞。

分化潛能由廣至窄,可概括為:多能性幹細胞可形成多種身體細胞,但不能單獨發育成完整個體;成體幹細胞通常具有組織或譜系限制,負責特定組織的維持與修復。

解題方法

每小題依「來源 → 分化能力 → 可能用途」作答,再補充其主要限制或特色。四者的區別在於:ESC 取自早期胚胎;ASC 取自出生後的組織;iPSC 由體細胞重新編程而得;治療性複製則以體細胞核移植至去核卵母細胞,建立可供取出胚胎幹細胞的胚胎。

各類幹細胞的來源及可能用途

(一)胚胎幹細胞(Embryonic Stem Cells, ESCs)

來源:​取自早期胚胎囊胚(blastocyst)內細胞團(inner cell mass),在體外培養後建立胚胎幹細胞株。取得細胞通常會破壞該囊胚。

分化能力:​具有多能性(pluripotency),可分化為三胚層來源的多種細胞,例如神經、心肌、胰臟及血球細胞,但不能單獨形成完整個體。

可能用途:

  1. 研究胚胎發育、細胞分化及基因功能。
  2. 建立疾病細胞模型,供藥物篩選及毒性試驗。
  3. 誘導分化為特定細胞,研究未來再生醫療用途。

限制:​若移植細胞未充分分化,可能形成畸胎瘤;異體移植亦有免疫排斥風險,且胚胎來源涉及倫理議題。

(二)成體幹細胞(Adult Stem Cells, ASCs)

來源:​存在於出生後的組織或器官中,負責組織維持及損傷後修復。例子包括骨髓造血幹細胞、間質幹細胞、皮膚幹細胞及腸道幹細胞。

分化能力:​通常具有多向分化能力(multipotency),但分化範圍多受原有組織或細胞譜系限制。例如造血幹細胞可形成多種血球細胞。

可能用途:

  1. 骨髓或造血幹細胞移植,用於治療部分血液疾病及血液惡性腫瘤。
  2. 皮膚幹細胞用於皮膚修復與燒燙傷照護研究。
  3. 間質幹細胞用於組織修復及免疫調節等研究。

特色與限制:​可由患者自身組織取得,較有機會降低免疫排斥與胚胎倫理爭議;但細胞數量有限、體外擴增不易,且分化潛能通常較 ESC 窄。

(三)誘導性多功能幹細胞(Induced Pluripotent Stem Cells, iPSCs)

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第 四 題20 分

基因治療最重要的一環是將治療基因帶入病人細胞中。請說明理想的基因運送方式應具備哪些條件?並請說明基因運送的方法有哪些?

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核心觀念

本題考查基因治療的「基因運送系統」(gene delivery system):如何將治療性核酸送入目標細胞,並使其在細胞內發揮作用。作答分成兩部分:先整理理想運送方式應具備的條件,再依運送工具分類說明方法。

運送方式的選擇會影響基因能否到達目標組織、進入細胞與細胞核、維持表現,以及是否引起免疫反應或其他副作用。不同方法各有優缺點,須依治療基因大小、目標細胞種類、所需表現時間及安全性需求選擇。

解題方法

先從基因運送的完整流程反推所需條件:運送工具須能抵達病灶、辨識目標細胞、進入細胞,並讓治療基因在細胞內表現;同時避免造成不可接受的毒性、免疫反應或基因組損傷。接著依是否使用病毒載體,將方法分為病毒性與非病毒性,再補充體內與體外基因導入方式。

理想基因運送方式應具備的條件

  1. 安全性高:不造成明顯毒性、致病性或嚴重免疫反應,也不應引發插入突變、癌化等不良後果。
  2. 運送效率高:能有效保護治療基因,並將其送入目標細胞及適當的細胞內位置;需要進入細胞核表現的基因,須能克服細胞膜與核膜等屏障。
  3. 目標專一性佳:優先作用於病灶或特定細胞,降低對正常組織的非預期影響。
  4. 基因表現符合治療需求:能提供足夠的表現量與適當的表現時間。短期治療可採短暫表現;需長期治療時則須維持較久的表現,並兼顧安全性。
  5. 可容納適當大小的遺傳物質:能裝載所需治療基因及必要調控序列;載體容量不足會限制基因選擇。
  6. 適用範圍廣且可達目標細胞:能配合目標組織與細胞特性,並適用於相關細胞的轉染或轉導需求。
  7. 製備與操作可行:製造、純化、保存與給藥程序穩定,品質容易控制,且具有臨床應用可行性。

基因運送的方法

一、病毒性載體

利用病毒進入宿主細胞的能力,將病毒基因移除或改造後,裝入治療基因。

  • 反轉錄病毒載體(retroviral vector):可將遺傳物質整合至宿主基因組,表現時間較長;主要限制是整合可能造成插入突變,且對非分裂細胞的導入能力有限。
  • 慢病毒載體(lentiviral vector):屬反轉錄病毒載體,可感染分裂中與非分裂細胞,常用於造血幹細胞等細胞的基因導入;仍須考量基因組整合相關風險。
  • 腺病毒載體(adenoviral vector):導入效率高,通常以非整合方式表現,適用細胞範圍廣;表現多為暫時性,且可能引起免疫反應。
  • 腺相關病毒載體(adeno-associated virus, AAV):相較之下免疫原性較低,可在部分組織維持較長時間表現;載體容量有限,且須考量受試者既有的抗體反應。
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第 五 題20 分

近年來腸道菌叢(Gut Microbiota)與疾病相關的研究逐漸受到重視,但由於腸道菌叢不容易培養,必須採用其他非培養的方法來分析,請說明可採用之方法有哪些?

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核心觀念

本題考查腸道菌叢的非培養分析方法。腸道中許多微生物難以在實驗室條件下培養,因此可直接分析糞便或腸道檢體中的微生物核酸、蛋白質或代謝物,了解菌群組成與功能。

常見方法可分為三類:

  • 分析菌相組成:16S rRNA 基因定序、宏基因體定序。
  • 分析菌群功能與活性:宏轉錄體、宏蛋白體、代謝體分析。
  • 比較菌群多樣性:以定序資料計算 α 多樣性及 β 多樣性。

解題方法

作答時依「看見有哪些菌、推知能做什麼、觀察實際產生什麼」的層次說明,並指出各方法的分析標的與適用限制。

  1. 16S rRNA 基因定序 直接萃取檢體 DNA,以通用引子擴增細菌 16S rRNA 基因的可變區,再進行定序。依序列相似度辨認細菌分類,建立菌相組成。此法常用於菌群概況調查,但主要適用於細菌與古菌,且通常只能提供相對豐度;分析解析度也可能不足以區分近緣種或菌株。

  2. 宏基因體定序(shotgun metagenomic sequencing) 直接定序檢體中所有微生物的總 DNA,不限於 16S 標記基因。可分析細菌、古菌、真菌及病毒,並較深入辨認物種或菌株,同時推測菌群具有的基因與代謝功能。它呈現的是群落的基因潛能,不等同於基因正在表現或功能正在發生。

  3. 宏轉錄體分析(metatranscriptomics) 分析檢體中的總 RNA,通常將 RNA 轉換為 cDNA 後定序,藉此了解菌群正在表現的基因。

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