114 高普考高考三級 農業技術 作物育種學 考古題詳解

114 年・高普考・高考三級・農業技術
試題代碼 作物育種學

第 一 題25 分

請試述下列名詞之意涵:(每小題 5 分,共 25 分)

(一) 數位育種(digital breeding)

(二) 核型分析(karyotype)

(三) 體胚發生(somatic embryogenesis)

(四) 雜交種水稻(hybrid rice)

(五) 表現度(expressivity)

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核心觀念與解題方法

本題是名詞解釋題,每小題 5 分。作答時先給出準確定義,再補充其目的、主要特徵或在作物育種上的用途。作物育種相關名詞可依「概念是什麼、如何運作、用在哪裡」組織答案;遺傳學名詞則要指出它描述的是表現型的哪一個面向。

(一)數位育種(digital breeding)

數位育種是運用數位科技與資料分析,支援作物育種決策及流程的育種方式。它整合基因型資料、表現型資料、環境資料及系譜等資訊,並透過資料庫、影像與感測技術、統計模型或人工智慧,進行性狀分析、品系評估、親本選擇及育種材料排序。

其核心不只是使用電腦,而是把育種過程中的資料蒐集、整合、分析與決策連結起來。例如以影像辨識田間植株性狀,搭配基因組選拔模型評估候選品系,可提高選拔效率,並協助處理多性狀、多環境的大量資料。

**作答要點:**指出「育種資料的數位化與整合分析」及其如何協助選拔、決策或加速育種流程。

(二)核型分析(karyotype)

核型分析是將細胞分裂中期的染色體製片、染色與攝影,依染色體的大小、著絲點位置、臂比及帶紋等特徵排列,藉以描述一個物種或個體的染色體組成與形態。

核型分析可確認染色體數目與形態,也可用來辨識性染色體、染色體倍數性,以及較大型的染色體結構變異。作物育種與細胞遺傳研究中,可用於分析多倍體、遠緣雜交後代及染色體變異材料。嚴格來說,karyotype 指染色體組成及其特徵;排列並觀察染色體的程序常稱核型分析。

**作答要點:**交代分析對象、排列依據與用途,避免只寫「觀察染色體」。

(三)體胚發生(somatic embryogenesis)

體胚發生是由非合子來源的體細胞或組織,在適當的離體培養條件下,經由胚性細胞形成具有胚胎發育特徵的體胚,並可進一步發育成完整植株的過程。體胚不經由受精形成,通常具有類似合子胚的發育階段,例如球形、心形、魚雷形及子葉形等。

體胚可直接由外植體形成,也可先經由愈傷組織間接形成。此技術可應用於大量繁殖、體細胞變異選拔、基因轉殖及植物再生;若由單一細胞或單一胚性細胞系再生,所得植株較有機會維持遺傳一致性。

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第 二 題25 分

請說明下列分析技術之目的,並分別寫出其所用的染劑為何?(每小題 5 分,共 25 分)

(一) G-banding

(二) Q-banding

(三) Agarose electrophoresis

(四) SDS-PAGE

(五) Pollen grain staining

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核心觀念

本題考查五種常見分析技術的分析對象、用途與染色方式。作答時先辨認對象是染色體、核酸、蛋白質或花粉,再配對染劑;電泳的膠體提供分離環境,染劑則用來顯示分離結果。

解題方法與各小題

(一) G-banding

  • **目的:**觀察染色體上明暗相間的 G 帶型,以辨認染色體及分析染色體的數目或結構異常,例如缺失、重複、倒位或易位。
  • **染劑:**Giemsa(吉姆薩)染液。典型處理會先以胰蛋白酶處理染色體,再進行 Giemsa 染色。

(二) Q-banding

  • **目的:**以螢光帶型辨認染色體,並分析染色體的數目或結構異常;可與 G-banding 一樣用於核型分析。
  • **染劑:**quinacrine(喹吖因;常用 quinacrine mustard)。以螢光顯微鏡觀察,可見明暗相間的 Q 帶。

(三) Agarose electrophoresis

  • **目的:**利用瓊脂糖凝膠分離核酸片段,常用於分析 DNA 或 RNA 的大小及樣品組成;較小的片段通常在相同條件下移動較快、距離較遠。
  • **染劑:**常用 ethidium bromide(溴化乙錠,EtBr)使核酸條帶可見。實務上也可使用 SYBR Green 等核酸染劑。

(四) SDS-PAGE

  • **目的:**以十二烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳分離蛋白質。SDS 使蛋白質變性並帶有大致相近的負電荷/質量比,因此通常依分子量大小分離;較小的蛋白質通常移動較快。
  • **染劑:**常用 Coomassie Brilliant Blue(考馬斯亮藍)染色,以顯示蛋白質條帶。

(五) Pollen grain staining

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第 三 題25 分

雜交育種是作物品種改良主要的策略,請以水稻為例比較利用譜系法及混合法進行雜交育種分離後代處理之操作流程與其優缺點。

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核心觀念

本題考查自交作物水稻的雜交後代如何從分離族群培育成穩定品系,重點在比較**譜系法(pedigree method)與混合法(bulk method)**的世代推進、選拔時點及紀錄方式。

水稻雜交後代自交時,雜合基因座逐代分離並趨於純合。以單一基因座為例,若 F1F_1 為雜合體,連續自交 nn 代後,仍為雜合的比例約為:

(12)n\left(\frac{1}{2}\right)^n

因此,愈後期世代的植株愈穩定,適合選拔可供品系比較的材料。不過,早期選拔可保留優良單株及其家系資訊;延後選拔則可減少早期逐株選拔和記錄的工作。

解題方法:依「何時選、怎麼留種、是否追蹤家系」比較

假設以兩個水稻品種作親本,人工雜交取得 F1F_1,之後讓後代自交。可依每一代的植株或種子如何處理,分別說明兩種方法。

譜系法的操作流程

  1. 親本雜交:選定具互補優良性狀的親本,例如一方具有良好株型,另一方具有抗病性,配製雜交取得 F1F_1 種子。
  2. 種植並繁殖 F1F_1:確認雜交植株後自交,收穫 F2F_2 種子。
  3. F2F_2 單株選拔:種植足量 F2F_2 植株,依育種目標選擇表現優良的單株;每株單獨收穫、編號,留下各自的種子。
  4. F3F_3 起按家系種植:將各 F2F_2 單株的種子分別種成家系或株行,觀察家系內分離與一致性,選取優良家系及家系內優良單株。
  5. 逐代選拔與記錄:在 F4F_4、F5F_5 等世代繼續依家系及單株表現選拔,記錄親本組合、家系與單株代號,保留清楚的譜系。
  6. 進入品系試驗:較穩定的後代可種成品系株行,淘汰不良品系,進行產量、品質、抗病性及區域適應性等試驗。

譜系法的核心是:早期選單株,後續按家系追蹤;各單株後代分開留種、分開評估。

混合法的操作流程

  1. 親本雜交並繁殖 F1F_1:與譜系法相同,種植 F1F_1 並自交,收穫 F2F_2。
  2. 分離世代以族群方式推進:將 F2F_2 植株種在族群田中,通常不逐株選拔;成熟後將族群植株的種子混合收穫,作為下一代種子。
  3. 逐代混合繁殖:F3F_3 至數個分離世代持續採用混合播種、混合收穫,使族群自交並逐代趨於純合。此期間主要由自然環境造成生存與繁殖上的淘汰。
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第 四 題25 分

請說明如何利用正向遺傳學(Forward Genetics)策略進行禾穀耐淹水功能性基因體研究。

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核心觀念

**正向遺傳學(forward genetics)**是從可觀察的表型差異出發,先找出與性狀連鎖或相關的基因座,再逐步定位、鑑定並驗證造成性狀差異的基因。研究方向可簡化為:

表型差異→遺傳定位→候選基因→功能驗證\text{表型差異} \rightarrow \text{遺傳定位} \rightarrow \text{候選基因} \rightarrow \text{功能驗證}

本題的性狀是禾穀作物在淹水或土壤水分飽和、根域缺氧條件下的耐受能力。耐淹水通常是複雜性狀,可能受到多個基因及環境影響;研究時須明確區分全株浸水與土壤水淹造成根部缺氧,因為兩者的受害部位、評估性狀與適應機制並不相同。

正向與反向遺傳學的差別在於研究起點:正向遺傳學從性狀找基因;反向遺傳學則先選定基因,再改變其功能並觀察表型。

解題方法

一、建立耐受與敏感材料,定義處理條件

蒐集或篩選具遺傳差異的材料,例如耐淹水品系與敏感品系。以標準化淹水處理比較兩者,並設置未淹水對照;處理條件須記錄生育期、淹水深度、持續時間、水溫及恢復期,且應在重複試驗與不同環境中確認表型穩定性。

評估指標可包括存活率、植株高度與伸長量、根系生物量、根系通氣組織(aerenchyma)形成、葉片黃化、復水後恢復能力及產量相關性狀。為降低植株大小與環境差異的影響,可同時比較淹水處理值與對照值,或分析相對變化率:

相對變化率=淹水處理值−未淹水對照值未淹水對照值\text{相對變化率} = \frac{\text{淹水處理值}-\text{未淹水對照值}} {\text{未淹水對照值}}

若以存活率等指標評估,須確保性狀定義和評分方式一致。耐受性不宜只用單一生長指標判定,因為植株可能在淹水下存活,卻在恢復生長或產量上受損。

二、建立遺傳族群並進行定位

以耐受親本和敏感親本雜交,建立 F2F_2、回交、重組自交系(RIL)或雙單倍體(DH)族群。利用分子標記或全基因組 SNP 對族群定型,將標記基因型與淹水表型進行連鎖分析,找出與耐受性相關的數量性狀基因座(QTL)。

若利用自然群體,則可進行全基因組關聯分析(GWAS),檢測標記與表型的統計關聯。分析時要控制族群結構與親緣關係,並在獨立材料或不同環境中確認關聯訊號。QTL 或 GWAS 訊號指出的是與性狀相關的基因組區域,不能直接等同於已證明功能的因果基因。

三、縮小區間並挑選候選基因

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